华癸中慢生根瘤菌7653R共生固氮相关新基因dmtH和autoL的克隆和功能鉴定

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本研究基于前期工作基础,已构建华癸中慢生根瘤菌7653R Tn5-sacB转座子突变体库,通过植物盆栽筛选获得7653R共生缺陷突变株HK115和HK483,二者与宿主植物紫云英的共生表型均为结瘤不固氮(nod+fix-)。利用TAIL-PCR方法克隆Tn5插入位点旁侧序列,与GenBank已公布基因组序列比较分析后,根据同源基因设计合适引物克隆获得其基因全长序列,分别命名为dmtH和autoL。  dmtH编码一个由249个氨基酸残基组成的蛋白质,分子量为27.3KDa。Blastn分析和蛋白质结构域预测表明:DmtH与去甲基甲基萘醌(DMK)甲基转移酶高度同源,仅在少数根瘤菌中分布。该蛋白催化电子传递载体甲基萘醌(MK)合成的最后一步,即依赖腺苷甲硫氨酸的转甲基反应。  为进一步研究dmtH在共生固氮中的功能,构建了dmtH的kan插入失活突变株HK116,该突变株诱导紫云英形成白色无效根瘤,且与野生型菌株7653R比较竞争结瘤能力降低。根瘤切片和电镜观察结果显示:HK116形成根瘤中仅含少量形态异常的类菌体,类菌体膜增厚,胞内可观察到明显PHB颗粒积累。dmtH互补表达载体pBBRgus-dmt能够恢复HK116的固氮功能,表明HK116的共生突变表型仅由dmtH突变所引起,确证了DmtH为根瘤菌7653R共生固氮所必需。  微氧培养时,突变株HK116胞内积累PHB相对含量达0.0937g/gDW,为野生型菌株7653R胞内PHB的2.46倍。好氧培养时,HK116在胞内PHB相对含量、生长速度和碳源利用能力等方面与7653R无显著差异,表明dmtH突变对好氧自生培养时根瘤菌7653R的生理特性没有明显影响,仅对微氧培养时PHB的代谢产生影响。荧光定量分析显示dmtH在自生培养细胞中基本不表达,而在接种根瘤菌25天后的根瘤中表达量最高,表明dmtH为共生特异诱导表达基因,在根瘤菌共生固氮阶段发挥功能。  基于对DmtH蛋白的功能预测,我们认为华癸中慢生根瘤菌7653R在共生固氮期间可能以甲基萘醌作为电子传递载体,但缺乏相关实验证据和文献报道。因此,本研究对7653R和突变株HK116在好氧和微氧培养条件下的醌组分进行了提取、高压液相色谱及质谱的比较鉴定。结果表明:好氧培养时,7653R中仅积累泛醌(UQ-10),微氧培养时则有甲基萘醌(MK-7)产生,而突变株HK116则没有甲基萘醌的产生。基于dmtH为共生特异表达基因,本研究合理推测该根瘤菌在共生期间可以甲基萘醌作为电子受体。  依据DMK转甲基酶对异戊二烯侧链的专一性不强,本研究利用大肠杆菌ubiE基因突变株JC7623Δ4-1仅产生DMK-8的特点,以之作为反应底物,通过体外酶活反应体系测定了DmtH转甲基活性。结果表明:以腺苷甲硫氨酸作为甲基供体,DmtH蛋白能够催化合成甲基萘醌,从而直接证明了DmtH具有转甲基酶活性功能。  autoL基因突变株亦形成无效根瘤,其编码产物由371个氨基酸组成,预测分子量41.5KDa。基因序列和蛋白质结构分析表明:AutoL蛋白属于糖苷键水解酶超家族蛋白,且与该家族的自溶酶蛋白序列高度同源,该酶参与细菌细胞壁的更新、细胞的分裂及病原菌感染寄主时的防御过程。本研究利用SOE-PCR和基因置换技术获得了autoL插入突变株HK1003,该突变株与紫云英共生形成白色无效根瘤,根瘤切片和电镜观察表明:突变株HK1003形成的根瘤中含菌细胞少,类菌体个体小且分化异常,胞内含少量PHB颗粒。另外,共生体膜也被观察到存在加厚的异常现象。因此,autoL可能与根瘤菌细胞壁的分解和抵抗植物的防御反应相关,从而影响共生体膜形成和类菌体分化,是根瘤菌共生固氮过程的必需基因。  
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