基于人类代谢酶网络的冠心病疾病风险模块识别

来源 :哈尔滨医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xtyygydskf
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
冠状动脉粥样硬化性心脏病(Coronary heart disease)通常是由动脉粥样硬化引起的,是动脉内壁上大量脂质堆积形成斑块,通过物理因素堵塞动脉,从而限制血液流向心脏肌肉,导致动脉张力和功能异常。很多研究表明,酶对动脉粥样硬化和冠心病的形成都有重要的影响作用,然而从系统生物学角度,生物代谢网络层面对冠心病疾病过程中酶的研究仍然处于空白状态。  在本研究中,我们基于人类代谢网络数据,根据酶促反应的上下游关系,构建人类酶代谢网络。并根据酶促反应位置信息,对人类酶代谢网络进行区域性划分,拆分成六个细胞器背景的子网络(细胞质,线粒体,高尔基体,细胞外基质,细胞核和内质网)。对每一个网络进行网络拓扑性质分析,发现它们都满足生物学网络无尺度、小世界的特性。以酶代谢网络为基础,构建打分算法模型,考虑泡沫细胞和巨噬细胞其网络特性在正常状态和疾病状态之间的变化情况,分别在整体人类酶代谢网络和不同细胞器背景的子网络中筛选冠心病疾病相关的风险酶(定义为报告代谢酶)。对这些报告代谢酶进行网络性质分析,并通过现有文献与实验研究对其进行验证。使用Cytoscape软件中的CMODE插件挖掘包含报告代谢酶的模块,寻找到7个冠心病疾病相关风险模块。通过对模块进行GO功能富集分析及功能类分类,发现主要富集在脂类代谢功能类、基础代谢功能类、细胞死亡代谢功能类等与冠心病发生发展密切相关的功能类。  总之,所有研究结果都显示了酶在冠心病疾病过程中起到了极为重要的作用。本文中揭示的报告代谢酶及其所在的疾病风险酶模块对冠心病的形成和发展都起到调控作用,这预示着酶标记物在未来可能为冠心病检测提供帮助。
其他文献
冷适应微生物是一类生活在低温环境中的特殊类型的极端环境微生物,嗜冷菌和耐冷菌.它们以独特的生理功能适应环境.该文对冷适应微生物的生态分布、主要类群适应低温的机制以
随着高速铁路的快速发展,“交-直-交”电力机车产生的高次谐波对牵引网的供电危害日益突出。引发的设备故障更是随处可见,严重危害到铁路的高速、安全、经济的运行。本文旨在
筹备达10年之久的“中国版纳斯达克”——创业板10月30日正式开市,全部28只股票首日涨幅均逾70%,最高者近210%。疯狂的游资与赴汤蹈火的散户,联手爆炒出了A股历史上最惊心动
风力发电技术因具备不排放废物、环保等优势,在众多新能源中脱颖而出,由此成为发展速度较快,且相对成熟的一种技术。但具体运行经验表明,大量的风电机组接入电力系统,导致系统电源结构因此而改变,进而使得低频振荡模式出现变化,并造成了系统稳定性的破坏。因此,研究大容量风电机组并网对电力系统低频振荡特性的影响,已成为时下热门课题之一。本文以应用最为广泛的DFIG(Doubly Fed Induction Ge
本文通过对荣华二采区10
中华民族是全国各民族的总称,这一名称是对长期生活在中国这片土地上的互相影响、融合、合并和分化的众民族的统一称呼.遗传多生是指群体中一个单基因性状有两种或者两种以上
目的:通过研究内皮细胞功能的增龄性改变及引起这些改变的机制,探讨其在老年性勃起功能障碍发病机制中的作用.方法:我们对比了青龄(5个月)老龄(20个月)大鼠海绵体内压(ICP)Ac
产溶剂梭菌作为重要的工业微生物,具有底物谱宽泛和产物种类丰富的特点,能够利用多种碳源发酵产生一系列化学品和生物燃料。其中,基于产溶剂梭菌的ABE(Acetone,Butanol,Ethanol)溶剂
该实验不仅证明海藻糖合成中的磷酸酯酶完全可由生物体自身的磷酸酯酶类来代替,同时也证明海藻糖的积累可以提高生物体的耐干性和耐盐性.这些数据表明单独otsA基因的转化可以
随着地区电网的不断发展,电网结构日趋复杂,用户对于电能质量的要求也日益提高,采取有效手段降低网损、改善电压水平,已经成为直接关系电力企业自身经济效益的重要课题。以前,大多数地区电网采用分散调整的方式实施无功电压控制,即在各变电所内利用本身所具有的无功资源(VOC)实施对变电所电压/无功控制。本文阐述了衢州电网电压无功控制现状并提出衢州电网的AVC系统详细设计方案。介绍了衢州地调AVC子站系统与浙江