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我国加入世贸组织后，改革开放的进程进入了一个全新的阶段，海关面临的改革和建设任务十分繁重。近30年的改革开放，中国经过结构性的调整，经济上的大转型，形势上出现了大的变化。我国各级政府的社会管理和公共服务职能得到了明显改善，政府的管理水平和公共服务质量有了显著提高。作为政府的一个行政管理部门，海关的工作与社会经济、生活等方方面面都息息相关，海关已成为促进和维护国家经济社会发展的一个重要角色。加工贸易管理作为现代海关制度的一个重要组成部分，时刻影响着我国对外经济贸易的发展。但是由于各种原因，目前我国加工贸易发展面临的问题及海关对加工贸易管理职能不到位的问题仍然比较突出。为此，我国海关以满足社会公众日益增长的公共服务需求为宗旨，以满足外贸增长方式转变为中心，积极探索和研究解决监管资源与快速发展的业务规模、监管手段与地方经济、监管效能与市场运营效益相适应等突出问题，全面推进加工贸易管理制度改革，逐步建立与加工贸易转型升级相适应，推进外贸增长方式转变，健全配套设施，严密监管与高效运作相统一，效率、质量和效能相协调的海关新型加工贸易管理新体系。
本文试图在理论与实践相结合的平台上探究目前我国海关对加工贸易管理能否适应并促进加工贸易转型升级，进而促进对外贸易和地方经济发展的问题。首先论述了加工贸易及海关对加工贸易管理的历史、现状及成因；然后，结合我国地方经济建设及加工贸易发展情况，以深圳关区为案例对象，分析加工贸易及加工贸易管理在地方经济发展过程中遇到的问题，论证海关对加工贸易管理改革的必要性与可行性；并从发达国家对加工贸易管理及深圳关区改革创建得到启示与借鉴；最后，剖析我国海关对加工贸易监管面临的问题，提出推动我国海关对加工贸易管理发展的对策。
本文采用了理论研究和实证研究相结合的方法。在理论研究中，运用了新公共服务理论，将新公共服务理论中有关政府建设的内容借鉴到海关对加工贸易管理之中，运用企业管理中的“流程再造”概念，探求海关对加工贸易监管的架构。在实证研究中，既分析了我国地方加工贸易及地方海关对加工贸易管理的一般情况，又对列举案例作深入剖析。
本文的研究证明，加工贸易管理作业流程再造是我国海关对加工贸易管理改革亟需推进的一种重要方式，研究中引进了风险管理的理论和模式。论文的主要创新如下：一是思路创新。借鉴西方国家新公共管理运动的思想，将公共服务和绩效管理的理念引入到海关管理工作中，分析海关对加工贸易管理的弊端及发展路径的问题。二是内容创新。流程再造，联网监管，风险管理，属于比较新的内容，本文将三者贯彻到海关的加工贸易管理当中。三是案例创新。借鉴西方发达国家对加工贸易管理的发展模式，结合本国深圳关区的富士康保税工厂“联网监管”模式发展案例，从服务与有效监管的角度进行剖析研究，提出推进我国海关对加工贸易管理改革建设的对策。