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冬瓜(Benincasa hispida Cogn．)和节瓜(Benincasa hispida Cogn． Var． chieh—qua How)均属葫芦科冬瓜属，在我国栽培历史悠久。本试验运用RAPD分子标记，对41个冬瓜和节瓜品种的遗传多样性进行了研究，主要研究成果如下：
1、针对瓜类作物多酚类和多糖等物质含量高，难以去除的特点，采用改良CTAB法探索出了一套提取高质量冬瓜和节瓜DNA的方法。
2、采用正交试验设计的方法，对冬瓜和节瓜RAPD条件进行了优化，建立了冬瓜和节瓜RAPD的最佳体系，即25μl反应体系中含1×buffer，模板DNA，Mg2+，dNTPs，引物，Taq酶的浓度分别为20ng，2.0mmol/L，0.24mmol/L，0.3μmol/L，1U。最适宜的退火温度是36.9℃，扩增程序为：94℃预变性5min，94℃变性45s，36.9℃退火45s，72℃延伸90s，共40个循环，72℃延伸10 min。
3、从455条引物中筛选出23条引物，对41个冬瓜和节瓜品种进行RAPD分析，共产生143条扩增带，其中多态性条带81条，多态性检测率为56.6％，扩增条带2—11条带，平均每条引物产生约6.2条带。
4、用软件NTSYSpc(2.10)处理RAPD数据，41个材料间遗传相似系数变化范围为0.60-0.99。聚类分析结果可将供试材料分为6个类群9亚类，主坐标分析可将供试材料分为6个类群10亚类。RAPD分类结果与冬瓜和节瓜的农艺性状和地理分布有一定的相关性。