泥鳅源益生乳酸菌的筛选及其益生菌株全基因组测序分析

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泥鳅由于肉质鲜美,营养丰富,被大量消费者所欢迎。但是高密度养殖却增加了泥鳅暴发流行病的概率。目前,大多数养殖户选择抗生素来对抗细菌病,但是考虑到抗生素对生态系统的危害,抗生素急需被取代。乳酸菌能够改善鱼体的生长性能,提高饲料利用率,增强机体免疫力以及有一定净化水质的能力,并且乳酸菌已被证明对宿主无害。且关于乳酸菌作用于泥鳅的研究还比较少。而魏斯氏菌(Weissella confusa)属于乳酸菌的一种;有关Weissellaconfusa的研究越来越多但仍缺乏Weissellaconfusa基因组相关信息的报道,特别是泥鳅源Weissellaconfusa基因组信息尚未见报道。
  本研究通过初筛,抗逆性试验和生理生化试验筛选到两株性状优良的乳酸菌,WeissellaconfusaN17和LactobacilluscaseiN19:N17和N19能够抑制多种常见水产病原菌,并对大多数常见抗生素不耐受;在10%的泥鳅胆汁中培养4h后,有50~60%左右的存活率;在pH=4的MRS中作用4h,有40%左右的存活率;对胰蛋白酶耐受;自聚集能力大于30%;疏水性大于30%;对维氏气单胞菌TH0426和嗜水气单胞菌TPS的聚集能力均大于30%;N17的产生物被膜能力较N19强,但均对EPC细胞具有高度粘附性;对泥鳅是安全的。并且经电镜观察,TH0426和TPS和N17和N19的培养上清液共同培养后,菌体出现不同程度的损伤。针对维氏气单胞菌TH0426,N17和N19对泥鳅的保护率分别为57.1%和44.4%。通过以上实验,最终选取菌株WeissellaconfusaN17进行全基因组测序,并利用一系列软件和数据库对该菌株的全基因组进行注释和分析;WeissellaconfusaN17基因组大小2,279,677bp,含有3个质粒,GC含量为44.85%,特有基因238个。
  综上所述,本实验通过检测乳酸菌的抑菌和益生能力筛选得到性状相对最优的菌株,这两株乳酸菌对泥鳅安全性高,产生物被膜能力较优,通过口服能够降低泥鳅被维氏气单胞菌感染后的死亡率。并且将WeissellaconfusaN17和LactobacilluscaseiN19作为饲料添加剂,对于促进泥鳅的生长和疾病的预防,具有广阔的应用前景和实践意义。而WeissellaconfusaN17全基因组测序为进一步阐明Weissellaconfusa的遗传背景提供了基础,为研究Weissellaconfusa代谢和调控机制提供了重要理论依据,同时为泥鳅源乳酸菌的研究提供了一个新的方向。
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