肿瘤恶化相关的IncRNAs功能与机制研究

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LncRNAs涉及多种生物调节过程,包括转录调节、转录后调节、蛋白定位以及蛋白降解等。尽管大多数lncRNAs的功能还没有研究清楚,但是越来越多的证据表明lncRNAs与癌症发生相关,可以作为癌症发展中新的调控因子发挥功能。本论文中,我们运用生物信息学和实验研究相结合的方法,对肿瘤恶化相关的公共数据、实验室自产的肿瘤芯片数据及SMAD3 ChIP-Seq数据进行重新分析和数据再发掘,并对其中3条差异表达的lncRNAs的功能和机制进行了深入研究。  第一部分工作中,鉴定了一条在前列腺癌和肺癌发展中差异表达的长非编码RNA LncRNA31,并首次发现LncRNA31是一个可以进行核质穿梭的lncRNA;LncRNA31抑制肿瘤细胞侵袭迁移。通过RNA pull-down和MS相结合的方法,发现LncRNA31与侵袭迁移蛋白VIM和E3 ubiquitin-protein ligase蛋白RNF20相互作用。转运受体蛋白CRM1介导LncRNA31出核,细胞质中的LncRNA31通过增强VIM-RNF20的相互作用而促进VIM蛋白泛素化降解,进而在肿瘤恶化发展中发挥抑制侵袭迁移的功能。  第二部分工作中,我们将SMAD3 ChIP-Seq数据与肺癌芯片数据相结合,鉴定了19条具有SMAD3结合位点的、在肺癌中差异表达的lncRNAs,并对其中一条长非编码RNA LINC01186的功能和机制进行了研究。LINC01186抑制肺癌细胞侵袭迁移。SMAD3能够下调LINC01186表达。敲降LINC01186影响EMT分子标记物的表达水平,推测LINC01186通过影响EMT发挥抑制肺癌细胞侵袭迁移的功能。  第三部分工作中,鉴定了一条在不同级别神经胶质瘤中差异表达的长非编码RNA并命名为LncTRIB2,敲降LncTRIB2抑制细胞增殖,促进细胞凋亡,抑制裸鼠体内肿瘤生长。LncTRIB2与相邻基因TRIB2的表达呈正相关且二者均与生存分析负相关。LncTRIB2与转录因子TCF4相互作用,调控Wnt通路下游效应因子TRIB2的表达。
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