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我国“十二五”纲要明确提出:“按照谁开发谁保护、谁受益谁补偿的原则，加快建立生态补偿机制。加大对重点生态功能区的均衡性转移支付力度，研究设立国家生态补偿专项资金。”在这一宏观背景之下，我国《生态补偿条例》的立法工作正在紧锣密鼓的进行之中。然而，立法工作面临的一个重大的问题就是:巨额生态补偿资金，其法律性质是什么，有哪些可供选择的法律形式，具体的制度应如何构建？ 面对这一实际情况，本文从问题出发，选取我国生态补偿中资金运用的法律形式及制度构建作为研究题目。 在本文第一部分，笔者从生态学、经济学（财政学）、法学的角度，对生态补偿的概念加以辨析，明确环境法领域以及生态补偿立法中生态补偿的概念;进而从上述三个学科的视角，对生态补偿的理论依据加以分析。此基础上，笔者对我国生态补偿的目的进行了分析，作为统领制度构建的主旨思想。 在本文第二部分，笔者从财政专项资金、财政转移支付两个角度，对生态补偿的财政法律制度加以分析。从资金来源、使用原则、补偿对象与用途、资金监管几个方面，对生态补偿国家财政资金运用的法律制度进行了研究。 在本文第三部分，笔者从生态补偿专项基金的法律性质、各国实践、资金来源、使用原则、补偿对象与用途、资金监管等方面，对生态补偿基金法律制度进行了分析。 在本文第四部分，笔者从概念、性质与国际实践经验入手，研究市场化生态补偿和生态补偿资金的市场化来源。在分析过程中，笔者还选取了我国市场化生态补偿试点案例加以分析，并指出了我国实践存在的问题。 在本文第五部分，笔者在上述分析的基础上，对如何构建我国多元化的生态补偿资金运用法律体系进行了研究，提出应综合运用财政资金、基金和市场化手段，充实我国生态补偿资金的来源，规范我国生态补偿资金的监管与运用。 在本文最后，笔者总结全文，提出我国应从生态补偿实践的经验和问题入手，结合我国实际情况、借鉴国外经验，整合现有零散的生态补偿资金运用法律制度，构建我国多元化的生态补偿资金运用法律体系，并在今后逐步推进市场化生态补偿发展的结论。