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“文化基因”是与基因相类比而产生的一个概念。人类从野蛮到文明进程中,逐步形成了涉及到人与自然、人与人(社会)、人与神(心与物)的相互关系和秩序的“价值观”、“思维方式”、“宗教信仰”等以“内隐的”方式存在的文化基本因子,它们可以被看作是“文化基因”,它储存了文化的信息,蕴含了文化的传播规律。正是文化基因的不同导致了不同民族进入文明阶段的路径不同。城市是人类从野蛮走向文明的标志,伴随着文明的产生而产生。城市空间是城市社会、经济、文化、历史以及各种活动的载体,是城市发展程度、阶段与过程的空间反映。它不仅是人类创造的文化产品,也是承载人类文化的容器。古代城市空间是城市空间的一种,具有城市空间的一般属性,是承载古代城市社会以及一切城市文化活动的容器,由古代府、州、县城以及宋代以后的市镇两大组成部分。以往关于城市空间的研究大多建立在以地理环境和生产力为主要因素的物质决定论基础上,把文化归结到精神因素,对其认识也着重在文化传统或文化现象,因此文化对城市空间影响的重要性并没有被完整地揭示出来。这就需要我们从文化整体观(包括物质的和精神的)的基础上,以基因的视角来看待城市空间的起源与演化。然而,目前关于文化基因与城市空间研究过程中存在着各自独立,缺乏联系的状况,对于两者之间的关系并没有完整与系统的研究。针对这一问题,本文基于文化“基因”的视角,认为文化传播具有与基因传递相类似的特征,文化的“基因”对文化系统具有控制作用,并有遗传、变异和选抒的能力。本文独创性地把文化基因与城市空间的关系类比于生物体的基因型与表现型之间的关系,把作为人类文化载体的城市看作文化基因的表现型,通过对吴文化与苏州古代城市空间的研究,探明吴文化基因与苏州古代城市空间的内在联系；以整体性和动态性的观点,运用城市科学与模因学的理论方法,结合文化人类学、历史学、考古学、社会学等学科的研究成果,通过田野调查与历史文献的研读,取得研究第一手资料,运用历史考察法和横向比较法,从历时性和共时性两个方面探求文化基因对城市空间的控制机制和规律：以时间为线索,揭示文化基因的变异与苏州古代城市社会变迁及城市空间结构与形态的演化之间历时性的对应关系。以空间为线索,运用系统论的观点,分析以儒家文化为核心的城市文化基因和以民间信仰为核心的乡土文化基因在城市空间和市镇空间中的控制作用。最后通过必要的哲学思辨,揭示文化基因与城市空间之间的对应关系以及在文化基因变异影响下的城市空间演化规律,从而得出结论,并为可持续发展的文化遗产的整体性和连续性保护提供一个新的思路。这是一项具有多学科交叉意义的研究成果。全文共分七章。第一章为绪论,通过对国内外相关研究成果的梳理与分析,提出目前关于文化基因和城市空间之间的研究存在着各自独立,缺乏联系的问题,明确本文以吴文化与苏州古代城市空间为研究对象,呈现两者之间的内在关系,这是本文研究的核心内容和新意所在；第二章,通过对吴文化基因内涵及特点的分析,探明其对春秋时期灵岩古城的选址、功能布局、空间结构与形态等方面产生的作用以及两者之间的对应关系；第三章到第五章,通过历时性的研究,选择六朝、两宋和明清三个历史时期,分析吴文化基因的变异在苏州古代城市社会的变迁与城市空间的演化中所起的控制作用,进一步揭示两者之间的对应关系；第六章,在前述历时性研究的基础上,进一步通过共时性的研究,探讨作为乡土文化基因的民间信仰对苏州古代市镇社会与市镇空间产生的控制作用。第七章为结语,总结全文,并提出后续研究的建议。研究表明,吴文化基因对苏州古代城市空间的控制作用是客观存在的,两者之间存在着有机的对应关系。进而,文化基因从社会性与物质性两方面对城市空间产生控制作用,文化基因的变异是推动城市社会变迁和城市空间演化的内部动力。