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目前我国大河大湖流域均不同程度地出现了水环境问题，由于缺乏有效的流域综合管理机制，这些问题呈现出越来越明显的流域性特征。湖泊流域水环境问题相对江河流域更有其特殊性。一方面，湖泊水系为区域发展提供了得天独厚的自然资源及便利的交通条件；另一方面，受湖泊环境容量、承载力及防洪需求等因素制约，流域内城市定位、规模、发展方向、产业结构等都会受到不同程度的影响。基于系统动力学模型研究流域发展的环境影响可为同类区域环境影响评价提供方法借鉴。
本文以巢湖流域作为研究样区，通过对流域内人口、经济规模、土地利用/覆被变化、产业结构等因素与水环境关系的剖析，提取巢湖流域发展的水环境影响因素，构建巢湖流域发展对水环境影响的系统动力学模型；通过对巢湖流域城市与区域相关规划的分析，归纳巢湖流域中长期发展的四种模式，运用系统动力学模型仿真模拟不同模式下巢湖流域发展的水环境影响，并提出相应对策，可为环境友好型区域发展政策的制定提供科学依据。文章主要结论如下：
(1)巢湖流域水环境大致经历了自然发展期、环境胁迫发展期、拮抗发展期和优化发展期四个阶段，表现出由自然状态到恶化、波动、趋于优化的特征。
(2)基于SD模型对流域发展及其水环境影响的模拟结果表明：巢湖流域中长期区域发展决策中宜适当提高城镇化目标，优化各时期城乡人口构成。为解决当前环保投入不足和污水处理率过低的问题，需要保持近期10％-15％，远期5％-10％的经济增长速度，以保障充足的环保投入和高城镇化水平。
(3)面源污染是影响巢湖流域水环境根本改善的核心问题，应从根本上改变目前环保投资一边倒向点源污染治理的局面，将面源污染治理作为巢湖流域水污染防治的长期工作重点。逐步提高农村生活污水集中处理率和畜禽粪便无害化处理率，减少化肥施用强度，因地制宜利用多种途径减少面源污染物排放。