【摘 要】
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目的：研究人感染H5N1型流感病毒的演化规律,为今后对该病毒的研究奠定理论基础,并为防控工作提供参考。 方法：从公开的流感病毒数据库中提取了189株H5N1型流感病毒的1047条
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目的：研究人感染H5N1型流感病毒的演化规律,为今后对该病毒的研究奠定理论基础,并为防控工作提供参考。
方法：从公开的流感病毒数据库中提取了189株H5N1型流感病毒的1047条核酸编码序列,在序列比对的基础上分别根据流感病毒的11个基因(HA、NA、NP、PA、PB1、PB2、MP1、MP2、NS1、NS2、PB1-F2)建立进化树。建树方法为邻接法,距离测度为Kimura双参数距离,可靠性检验采用自展法,自展次数均为1000次。分别根据各基因的核酸序列编码区估算各基因的进化速率,估算方法为马尔可夫链蒙特卡洛模拟结合贝叶斯分析。
结果：根据HA基因可以将人感染H5N1型禽流感病毒划分为3个世系,分别对应1997-1998年香港毒株,2004-05年中南半岛毒株和2003年以后的其他毒株。除HA基因之外,其余10个基因都可以被划分为两个世系,分别对应1997-97年香港毒株和2003年起分离到的毒株。后者还可以进一步划分为4个亚系,分别对应流感病毒不同的流行地域,即印度尼西亚、西亚中东北非、中南半岛和中国大陆。各基因进化速率不等。2003年以后分离的毒株中同流感病毒毒力相关的MP2,NS1,HA和PB1-F2基因的进化速率最高。
结论：1997年毒株同2003年起的毒株属于不同的世系,后者已经演化为若干地区性亚系,H5N1型流感病毒可能已经在多个地区长期存在,其毒力呈增强态势。
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