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最近几年出现的高感染性的禽流感A型病毒H5N1亚型，给人类的健康造成了潜在的威胁，因此阐明流感病毒的复制及转录机制对于研究出抗禽流感病毒的药物具有重要意义。禽流感病毒RNA依赖性的RNA聚合酶对于该病毒的复制及转录具有关键作用。该聚合酶具有三个亚基，分别是PA，PB1，PB2。PB1具有RNA聚合酶的活性。PB2与cap结合有关。PA首先被发现参与RNA复制作用，随后的研究发现PA也参与病毒RNA转录以及核酸内切酶催化过程，并被发现具有蛋白酶的活性，但其自身发挥作用的功能机制却不清楚。我们解析并首次报道了H5N1亚型禽流感病毒PA亚基的C末端第257到第716个氨基酸(PAc)与PB1的N末端第1到第25个氨基酸(PB1n)的2.9(A)分辨率的晶体结构。根据对晶体结构的观察，我们发现PAc的折叠类似一个龙头，它与PB1的N末端的结合部位如同龙嘴。PA亚基的C末端与PB1的N末端复合物结构清晰的揭示了PA与PB1结合的细节。同时，我们通过对这个结构的分析发现在PA分子上找到了一个可能的与核酸结合的大沟以及一个可能的分子通道。PA结构的揭示为进一步研究PA功能提供了重要的结构基础，同时，这一结构也为设计抗禽流感的药物提供了重要的参考。