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本文从以下两部分进行了阐述:
第一部分 长链非编码RNA lncCMPK2促进结直肠癌增殖的功能和机制研究
研究目的:
结直肠癌是一种常见的恶性肿瘤,在全世界范围内其发病率和死亡率均较高,晚期病人治疗效果差。长链非编码RNA(lncRNA)具有重要功能,其表达异常与包括癌症在内的多种疾病相关。本研究旨在通过组织芯片筛选与结直肠癌转移相关的lncRNA,并研究其在肿瘤中的功能与机制,以期为结直肠癌的诊断和治疗提供新的思路。
研究方法:
1.利用基因芯片技术筛选转移与非转移性结直肠癌中差异表达的lncRNA并确定研究目标lncCMPK2。
2.应用荧光定量逆转录PCR(quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR)检测40例结直肠癌组织标本及其配对正常组织中lncCMPK2的表达,并分析表达与临床参数间的关系。qRT-PCR检测结直肠癌细胞系和正常细胞株中lncCMPK2的表达。
3.核浆分离观察lncCMPK2在细胞内的定位。
4.建立lncCMPK2稳定干扰和过表达细胞株,通过CCK8,平板克隆,划痕,transwell和流式细胞学技术检测lncCMPK2对结直肠癌细胞增殖、平板克隆形成和细胞周期的影响,在体内检测了裸鼠异种移殖皮下成瘤能力。
5.RNA pull-down实验结合质谱技术确定lncCMPK2的结合蛋白FUBP3。用RNA免疫共沉淀(RNA imunoprecipitation,RIP)和Western-blot进一步证实lncCMPK2与FUBP3的结合。
6.Western-blot检测lncCMPK2对FUBP3和c-MYC蛋白表达的影响。泛素化实验检测lncCMPK2对FUBP3泛素蛋白酶体降解途径的影响。用放线菌酮抑制蛋白质合成后检测FUBP3的蛋白稳定性。
7.在稳定过表达lncCMPK2的细胞中用si-RNA干扰FUBP3或在稳定干扰lncCMPK2后外源性过表达FUBP3,用Western-blot检测c-MYC的变化,用CCK8检测细胞增殖能力的影响。
8.染色质共沉淀(CHIP)实验观察lncCMPK2对FUBP3与c-MYC基因上游序列FUSE的结合作用。
研究结果:
1.通过基因表达谱芯片我们发现lncCMPK2在转移性结肠癌中表达升高。
2.qRT-PCR结果显示,在40例结直肠癌患者中,有37例lncCMPK2在癌组织中表达较正常组织高,其表达和肿瘤大小、T分期、N分期及临床分期呈正相关,而和病人年龄,性别,肿瘤分化无关。lncCMPK2在结直肠癌细胞系中表达较正常结直肠上皮细胞升高。
3. lncCMPK2定位于细胞核。
4.干扰lncCMPK2的表达后细胞体外增殖速度减慢,平板克隆形成能力下降,细胞周期G1期细胞比例增多,裸鼠异种移殖皮下瘤生长变慢。过表达lncCMPK2后则结果相反。lncCMPK2对迁移和侵袭没有影响。
5.FUBP3是lncCMPK2的结合蛋白。lncCMPK2可以抑制FUBP3泛素-蛋白酶体途径的降解,增加FUBP3的蛋白稳定性。
6. lncCMPK2通过FUBP3促进c-Myc的表达,干扰FUBP3能够恢复lncCMPK2过表达引起的c-MYC蛋白改变和细胞增殖能力的变化。
7. lncCMPK2引导FUBP3与c-MYC的上游序列FUSE结合,激活c-MYC基因的表达,通过调控c-Myc下游周期相关基因促进细胞增殖。
研究结论:
1.LncCMPK2在结直肠癌组织中较配对正常组织表达显著上调,其在癌组织中的表达和肿瘤大小、T分期、N分期以及临床分期正相关。
2.LncCMPK2促进结直肠癌细胞的增殖和平板克隆形成能力,促进细胞周期从Gl期到S期转变。
3.LncCMPK2通过直接结合增加FUBP3蛋白的稳定性,并引导FUBP3与c-MYC的上游序列FUSE结合,激活c-MYC基因的表达,从而促进结直肠癌细胞的增殖。
第二部分 LASP1通过负调抑癌基因PTEN促进鼻咽癌的进展
研究目的:
LASP1在结直肠癌、胃癌和食管癌中均有报道与肿瘤发生发展相关,能够促进肿瘤的增殖、转移,而在鼻咽癌中尚未报道。本研究旨在检测LASP1在鼻咽癌中的表达,探讨其在鼻咽癌中的功能和分子机制。
研究方法:
1.采用qRT-PCR、western blot( WB)和免疫组化技术检测LASP1在组织和细胞中的表达情况,并且分析LASP1表达和鼻咽癌患者病理参数和预后之间的关系。
2.利用体内体外实验检测LASP1稳定干扰和过表达后鼻咽癌细胞增殖、细胞周期、凋亡和侵袭迁移能力以及对肿瘤细胞在裸鼠体内成瘤能力的改变。
3.在鼻咽癌中用GSEA富集到LASP1相关的信号通路PI3K,Western blot证实LASP1能够通过下调PTEN激活PI3K-AKT通路。
4.Western blot检测了鼻咽癌细胞中LASP1与PTEN的表达关系以及LASP1对PTEN蛋白的影响,免疫组化检测鼻咽癌组织中和裸鼠皮下瘤组织中LASP1和PTEN表达量之间的关系。
5.免疫共沉淀( CO-IP)验证LASP1与PTEN结合;免疫荧光观察LASP1和PTEN的共定位,western blot检测LASP1对PTEN蛋白泛素化的影响。
6.同时过表达LASP1和PTEN或同时干扰LASP1和PTEN后,Western blot检测AKT磷酸化的改变,观察LASP1是否通过PTEN影响PI3K-AKT通路。
7.CCK8、Transwell和细胞划痕实验检测LASP1是否通过PTEN促进鼻咽癌细胞的增殖、侵袭迁移。
研究结果:
1.LASP1在鼻咽癌细胞系和鼻咽癌组织中表达升高;相对于非转移性鼻咽癌组织,转移性鼻咽癌组织中LASP1表达相对较高。
2.LASP1的表达量与T、N、M分期以及临床分期成正相关性,LASP1高表达组患者的总体生存期相对LASP1低表达组短。
3.体外实验结果显示LASP1能够促进鼻咽癌细胞增殖、侵袭迁移,抑制细胞凋亡。体内实验结果显示LASP1过表达组的肿瘤细胞在裸鼠体内生长较快。
4.GSEA分析发现PI3K/AKT信号通路在LASP1高表达组富集,LASP1通过激活PI3K/AKT通路促进鼻咽癌细胞的增殖、侵袭迁移,抑制细胞凋亡。
5.在鼻咽癌细胞系和鼻咽癌组织中,PTEN的表达与LASP1的表达呈负相关,在5-8F细胞中干扰LASP1则PTEN表达增多,在6-10B细胞中过表达LASP1则引起PTEN表达减少。
6.免疫共沉淀(CO-IP)显示LASP1能够与PTEN相互结合,免疫荧光结果显示LASP1与PTEN在5-8F和6-10B细胞的胞浆中存在共定位。LASP1能够促进PTEN蛋白的泛素化,导致PTEN蛋白的降解。
7.LASP1通过负调PTEN激活PI3K/AKT信号通路从而促进鼻咽癌细胞的增殖、侵袭和迁移,抑制细胞凋亡。
研究结论:
1.LASP1在鼻咽癌中表达增加,与鼻咽癌的转移和患者的预后相关。
2.LASP1能够促进鼻咽癌细胞增殖、侵袭、迁移,抑制细胞凋亡。
3.LASP1蛋白能够通过泛素-蛋白酶体途径降解PTEN并激活PI3K/AKT通路,进而促进鼻咽癌细胞的进展。
第一部分 长链非编码RNA lncCMPK2促进结直肠癌增殖的功能和机制研究
研究目的:
结直肠癌是一种常见的恶性肿瘤,在全世界范围内其发病率和死亡率均较高,晚期病人治疗效果差。长链非编码RNA(lncRNA)具有重要功能,其表达异常与包括癌症在内的多种疾病相关。本研究旨在通过组织芯片筛选与结直肠癌转移相关的lncRNA,并研究其在肿瘤中的功能与机制,以期为结直肠癌的诊断和治疗提供新的思路。
研究方法:
1.利用基因芯片技术筛选转移与非转移性结直肠癌中差异表达的lncRNA并确定研究目标lncCMPK2。
2.应用荧光定量逆转录PCR(quantitative reverse transcription PCR,qRT-PCR)检测40例结直肠癌组织标本及其配对正常组织中lncCMPK2的表达,并分析表达与临床参数间的关系。qRT-PCR检测结直肠癌细胞系和正常细胞株中lncCMPK2的表达。
3.核浆分离观察lncCMPK2在细胞内的定位。
4.建立lncCMPK2稳定干扰和过表达细胞株,通过CCK8,平板克隆,划痕,transwell和流式细胞学技术检测lncCMPK2对结直肠癌细胞增殖、平板克隆形成和细胞周期的影响,在体内检测了裸鼠异种移殖皮下成瘤能力。
5.RNA pull-down实验结合质谱技术确定lncCMPK2的结合蛋白FUBP3。用RNA免疫共沉淀(RNA imunoprecipitation,RIP)和Western-blot进一步证实lncCMPK2与FUBP3的结合。
6.Western-blot检测lncCMPK2对FUBP3和c-MYC蛋白表达的影响。泛素化实验检测lncCMPK2对FUBP3泛素蛋白酶体降解途径的影响。用放线菌酮抑制蛋白质合成后检测FUBP3的蛋白稳定性。
7.在稳定过表达lncCMPK2的细胞中用si-RNA干扰FUBP3或在稳定干扰lncCMPK2后外源性过表达FUBP3,用Western-blot检测c-MYC的变化,用CCK8检测细胞增殖能力的影响。
8.染色质共沉淀(CHIP)实验观察lncCMPK2对FUBP3与c-MYC基因上游序列FUSE的结合作用。
研究结果:
1.通过基因表达谱芯片我们发现lncCMPK2在转移性结肠癌中表达升高。
2.qRT-PCR结果显示,在40例结直肠癌患者中,有37例lncCMPK2在癌组织中表达较正常组织高,其表达和肿瘤大小、T分期、N分期及临床分期呈正相关,而和病人年龄,性别,肿瘤分化无关。lncCMPK2在结直肠癌细胞系中表达较正常结直肠上皮细胞升高。
3. lncCMPK2定位于细胞核。
4.干扰lncCMPK2的表达后细胞体外增殖速度减慢,平板克隆形成能力下降,细胞周期G1期细胞比例增多,裸鼠异种移殖皮下瘤生长变慢。过表达lncCMPK2后则结果相反。lncCMPK2对迁移和侵袭没有影响。
5.FUBP3是lncCMPK2的结合蛋白。lncCMPK2可以抑制FUBP3泛素-蛋白酶体途径的降解,增加FUBP3的蛋白稳定性。
6. lncCMPK2通过FUBP3促进c-Myc的表达,干扰FUBP3能够恢复lncCMPK2过表达引起的c-MYC蛋白改变和细胞增殖能力的变化。
7. lncCMPK2引导FUBP3与c-MYC的上游序列FUSE结合,激活c-MYC基因的表达,通过调控c-Myc下游周期相关基因促进细胞增殖。
研究结论:
1.LncCMPK2在结直肠癌组织中较配对正常组织表达显著上调,其在癌组织中的表达和肿瘤大小、T分期、N分期以及临床分期正相关。
2.LncCMPK2促进结直肠癌细胞的增殖和平板克隆形成能力,促进细胞周期从Gl期到S期转变。
3.LncCMPK2通过直接结合增加FUBP3蛋白的稳定性,并引导FUBP3与c-MYC的上游序列FUSE结合,激活c-MYC基因的表达,从而促进结直肠癌细胞的增殖。
第二部分 LASP1通过负调抑癌基因PTEN促进鼻咽癌的进展
研究目的:
LASP1在结直肠癌、胃癌和食管癌中均有报道与肿瘤发生发展相关,能够促进肿瘤的增殖、转移,而在鼻咽癌中尚未报道。本研究旨在检测LASP1在鼻咽癌中的表达,探讨其在鼻咽癌中的功能和分子机制。
研究方法:
1.采用qRT-PCR、western blot( WB)和免疫组化技术检测LASP1在组织和细胞中的表达情况,并且分析LASP1表达和鼻咽癌患者病理参数和预后之间的关系。
2.利用体内体外实验检测LASP1稳定干扰和过表达后鼻咽癌细胞增殖、细胞周期、凋亡和侵袭迁移能力以及对肿瘤细胞在裸鼠体内成瘤能力的改变。
3.在鼻咽癌中用GSEA富集到LASP1相关的信号通路PI3K,Western blot证实LASP1能够通过下调PTEN激活PI3K-AKT通路。
4.Western blot检测了鼻咽癌细胞中LASP1与PTEN的表达关系以及LASP1对PTEN蛋白的影响,免疫组化检测鼻咽癌组织中和裸鼠皮下瘤组织中LASP1和PTEN表达量之间的关系。
5.免疫共沉淀( CO-IP)验证LASP1与PTEN结合;免疫荧光观察LASP1和PTEN的共定位,western blot检测LASP1对PTEN蛋白泛素化的影响。
6.同时过表达LASP1和PTEN或同时干扰LASP1和PTEN后,Western blot检测AKT磷酸化的改变,观察LASP1是否通过PTEN影响PI3K-AKT通路。
7.CCK8、Transwell和细胞划痕实验检测LASP1是否通过PTEN促进鼻咽癌细胞的增殖、侵袭迁移。
研究结果:
1.LASP1在鼻咽癌细胞系和鼻咽癌组织中表达升高;相对于非转移性鼻咽癌组织,转移性鼻咽癌组织中LASP1表达相对较高。
2.LASP1的表达量与T、N、M分期以及临床分期成正相关性,LASP1高表达组患者的总体生存期相对LASP1低表达组短。
3.体外实验结果显示LASP1能够促进鼻咽癌细胞增殖、侵袭迁移,抑制细胞凋亡。体内实验结果显示LASP1过表达组的肿瘤细胞在裸鼠体内生长较快。
4.GSEA分析发现PI3K/AKT信号通路在LASP1高表达组富集,LASP1通过激活PI3K/AKT通路促进鼻咽癌细胞的增殖、侵袭迁移,抑制细胞凋亡。
5.在鼻咽癌细胞系和鼻咽癌组织中,PTEN的表达与LASP1的表达呈负相关,在5-8F细胞中干扰LASP1则PTEN表达增多,在6-10B细胞中过表达LASP1则引起PTEN表达减少。
6.免疫共沉淀(CO-IP)显示LASP1能够与PTEN相互结合,免疫荧光结果显示LASP1与PTEN在5-8F和6-10B细胞的胞浆中存在共定位。LASP1能够促进PTEN蛋白的泛素化,导致PTEN蛋白的降解。
7.LASP1通过负调PTEN激活PI3K/AKT信号通路从而促进鼻咽癌细胞的增殖、侵袭和迁移,抑制细胞凋亡。
研究结论:
1.LASP1在鼻咽癌中表达增加,与鼻咽癌的转移和患者的预后相关。
2.LASP1能够促进鼻咽癌细胞增殖、侵袭、迁移,抑制细胞凋亡。
3.LASP1蛋白能够通过泛素-蛋白酶体途径降解PTEN并激活PI3K/AKT通路,进而促进鼻咽癌细胞的进展。