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大弹涂鱼(1Boleophthalmus pectinirostris)隶属于鲈形目、虾虎鱼科、背眼虾虎鱼亚科，分布于中国、日本和朝鲜半岛，是一种重要的经济鱼类。目前对它的研究多集中于形态、生理生化、人工繁育等方面，而对它遗传背景的了解较少。本研究通过对线粒体细胞色素b基因测序分析，对长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼的遗传结构及其群体历史进行了研究。
本研究从上海九段沙、浙江定海、慈溪、福建霞浦4个地区的42尾大弹涂鱼样本中获得33个1141bp细胞色素b基因全序列单倍型，并分析了其遗传多样性。结果显示，长江口及其南部邻近地区的大弹涂鱼遗传多样性较高，但群体间分化程度较低，基因交流频繁。表现在群体分化指数较低(0.00043～0.07814)，而基因流值Nm较高(14.50～30.79)以及仅有很少的变异(1.93％)是来自于群体间。而群体间的遗传距离尚未达到种群的级别，邻接法构建的系统发育树和网状亲缘关系图显示各采样点大弹涂鱼群体并未形成各自的单系群，表明长江口及其南部邻近地区的大弹涂鱼是属于同一个种群且正处于谱系重排阶段。
系统发育树和网状亲缘关系图都显示，大弹涂鱼细胞色素b全序列单倍型形成了序列差异较大的两个分支，序列差异为1％，显示大弹涂鱼历史上曾经出现过分化；根据分支间序列差异值1％-2.5％/百万年的细胞色素b分子钟，推测两分支的分化时间大约为0.5-0.2.百万年：我们推测，更新世的冰川作用可能是造成大弹涂鱼分化的主要原因。
高的单倍型多样性 h(h=0.9814±0.0118)和低的核苷酸多样性π(π=0.0048±0.0026)，网状亲缘关系图呈非典型星状排列，错配分布图上呈一条单峰型曲线，以及Tajima的D中性检验上呈现显著负值都表明长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼历史上可能由于受到过"瓶颈效应"的打击，曾经历了一个种群数量扩张阶段；经过估算，发生种群扩张的时间约为0.07-0.02百万年，即在更新世晚期经历了一次种群扩张。
在进行上述研究时，通过形态特征的测量和线粒体DNA细胞色素b基因序列分析，发现了弹涂鱼属的1个中国新纪录种，即大鳍弹涂鱼Periophthalmus magnuspinnatus。新纪录种与中国近缘种弹涂鱼P.modestus的主要形态区别为：第1背鳍大而高，第1鳍棘呈丝状延长，各鳍棘尖明显伸出鳍膜；第2背鳍各鳍棘中部以下颜色均一，无黑斑；第1背鳍和第2背鳍基部之间间距较小；左右腹鳍基部愈合处凹陷较浅。序列分析表明，新纪录种与弹涂鱼P.modestus的细胞色素b基因全序列平均K2-P遗传距离高达17.13％，在分子系统树上也分别聚为两个不同的支序，证实了新纪录种的有效性。新纪录种在中国的渤海、黄海、东海和南海的沿海都有分布记录。