基于iTRAQ技术的脂多糖诱导早期内毒素耐受相关蛋白的筛选

来源 :西南医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:tp137907226
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
目的:构建小鼠巨噬细胞RAW264.7内毒素耐受和脓毒症模型,使用iTRAQ技术分析内毒素耐受状态下与脓毒症状态下差异性蛋白的表达,探讨早期内毒素耐受机制。  方法:  1.用含10%胎牛血清的高糖型DMEM培养基(完全培养基)体外培养小鼠巨噬细胞RAW246.7,获取活力良好的细胞后,取对数期细胞,计数板计数,调浓度为5×105/ml,接种于6cm培养皿,使用随机数字法分成2组,分别为内毒素耐受组(耐受组)和脓毒症组,两组种板后均用完全培养基培养24h。  2.24h后更换培养液,耐受组用含10ng/ml LPS的完全培养基3ml,预处理细胞24h,脓毒症组用完全培养基3ml培养24h,24h后两组再次更换培养液,用含100ng/ml LPS的完全培养基刺激细胞4h、24h;  3.刺激4h后,(1)离心,取细胞沉淀,于-80℃冰箱保存,收集培养液上清,在实验过程中显微镜观察各组细胞形态变化并拍照。(2)取培养液上清液行ELISA检测TNF-α、IL-6、IL-10。(3)流式细胞术检测巨噬细胞膜上CD16/32表达。(4)提取蛋白,进行iTRAQ标记,筛选出差异蛋白,然后使用生物信息学分析(GO注释、KEGG信号通路,蛋白网络互作图、韦恩图)。  4.刺激24h后,用流式细胞术检测巨噬细胞膜上CD16/32表达。  5.细胞处理及样本留取采用3次生物学重复,收集和统计数据,分析结果。  结果:  1.耐受组预处理后较脓毒症组巨噬细胞活化明显,伸出伪足,表面积变大,贴壁更紧密。  2.ELISA检测细胞因子浓度:耐受组刺激4h时细胞上清中TNF-α水平(18273.5±10154.4pg/ml)较脓毒症组(133233.7±68955.9pg/ml)明显降低,差异有统计学意义,P值<0.05,且细胞上清中IL-6水平(1549.8±399.2pg/ml)较脓毒症组(3175.8±959.0pg/ml)明显降低,差异有统计学意义,P值<0.05;但IL-10水平(351.1±184.2pg/ml)较脓毒症组(220.3±121.4pg/ml)略有升高,无统计学差别,P值>0.05。  3.流式细胞术检测巨噬细胞膜上CD16/32表达:耐受组刺激4h后细胞表面CD16/32阳性率(75.33%)较脓毒症组(49.69%)高,P<0.05;刺激24h细胞表面CD16/32阳性率(79.07%)较脓毒症组(94.27%)低,P<0.05,但与阴性对照组(54.11%)相比,脓毒症组和耐受组CD16/32均增高,P<0.05。  4.刺激4h后,用iTRAQ技术分析,两组共鉴定到4086个蛋白,而耐受组与脓毒症组的总蛋白比较,有63个显著差异表达蛋白,其中36个上调(比值>1.2),27个蛋白下调(比值<0.833)。  结果:  1.GO注释:差异蛋白的生物学过程主要参与器官组织生长发育、生物质量调节、外界刺激反应;分子功能主要是氧化还原酶激活、受体连接、DNA连接、抗氧化活性;细胞组分涉及染色质、胞外区、膜小泡、细胞质囊泡。  2.KEGG信号通路分析63个差异蛋白共获得112条信号通路,其中P<0.05的信号通路有27条,主要有TLR信号通路、NF-κB信号通路和TNF信号通路以及PPAR信号通路。  3.蛋白互作网络图中见HMGA1、HMGA2、HMGB1、HMGB2蛋白存在相互关联。  4.韦恩图中完全重叠部分共有差异蛋白35个,其中21个蛋白上调,14个蛋白下调。  结论:  1.初始10ng/ml LPS预处理24小时,随后100ng/ml LPS刺激4小时能诱导出巨噬细胞早期内毒素耐受模型。  2.在内毒素耐受早期状态时促炎因子TNF-α、IL-6表达降低,IL-10水平略有升高。  3.使用iTRAQ技术能鉴定出蛋白并进行早期内毒素耐受差异蛋白的筛选,生物信息学对这些可能与早期内毒素耐受相关的蛋白进行分析,有助于总结可能参与内毒素耐受的蛋白的功能、所在的细胞成分及蛋白间相互联系、可能相关的信号通路。
其他文献
自优质护理服务示范工程提出以来,护理服务质量受到了各界的广泛关注,护理专业价值是实现护理专业实践的核心,护理专业价值体现于护理服务价值、护理文化价值、护士自身价值三方
本文从混凝土组成成分如水泥、外加剂、粗细骨料等对混凝土内部结构产生的不同影响,说明混凝土质量该从生产混凝土的原材料的质量开始把关,对混凝土的质量控制是一个全过程的
本文结合着公墓志水库的具体工程,主要就是阐述了关于灌浆防渗施工技术,以及在施工过程中的质量控制和施工方法.
结合以往高速公路桥梁设计体会,探讨预应力混凝土连续桥梁中的问题.
随着人们生活水平的不断提高,要求居住环境宽敞舒适,而且希望具有设备完善、功能齐全、使用方便的厨房、卫生间.然而由于设计、施工等方面的原因,导致屋面、厨房、卫生问经常
近年来,我国连续梁桥施工建设每年都有一个新的水平,连续梁桥施工关键技术已经成为一种新技术,而且在建设热潮的背后,一直都存在着关于连续梁桥施工关键技术问题,加上桥梁维
园林景观在我国有着悠久的历史,随着经济的发展,园林景观建设在我国开始兴旺繁荣了起来.笔者结合自身的行业经验,以园林景观施工的组织和管理为主线,对园林景观的施工工艺流
在建筑物中,为了解决钢筋混凝土收缩变形和温度应力,往往需要设置变形缝,在施工中,根据工程需要,用混凝土浇筑密实成连续整体的结构体,这就是后浇带.本文主要就混凝土后浇带
第一部分405例主动脉夹层患者合并肾囊肿的回顾性分析目的:通过对405例主动脉夹层病例进行回顾性分析,重点分析其合并肾囊肿的情况,了解主动脉夹层与肾囊肿的相关性。方法:对20
水的可持续利用和保护,是政府和广大人民群众关注的焦点.也是每一位给排水工作人员在设计时所必须考虑的问题,给建筑给排水工程设计提出了许多新的要求,作为建筑给排水设计人