基于直接法的蛋白质晶体结构双空间碎片扩展研究

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本文对直接法在蛋白质晶体结构双空间碎片扩展的应用作了系统的研究,主要包括三个方面的内容:   一、利用SIR数据的、结构碎片的直接法迭代扩展。将SOLVE/RESOLVE程序找到的部分结构送入OASIS+DM+RESOLVE(BuildOnly)进行双空间迭代,可以将SOLVE/RESOLVE的结果大大改善,证明了直接法对于SIR和低分辨数据同样起作用,而SOLVE/RESOLVE与双空间碎片扩展方法的结合也被证明行之有效。   二、利用MR数据的、结构碎片的直接法迭代扩展。利用修饰后的P+概率公式将分子置换法未能完全解出的部分结构进行双空间的碎片扩展,从而完成了结构解析的程序自动化。   三、基于OASIS-2004进行修订,推出了OASIS-2006程序。在OASIS-2004的基础上,加入了修饰P+概率公式等新算法,使其可以用于没有SAD/SIR信息的数据。
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