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目的研究叶酰多聚谷氨酸合成酶（FPGS）基因编码区单核苷酸多态性在深圳地区汉族急性白血病（AL）患儿与健康儿童中的等位基因频率和基因型分布特征，为进一步探讨FPGS基因多态性与甲氨喋呤（MTX）药物敏感性可能存在的关系，进而为肿瘤化疗的个体化用药提供可能的理论参考依据。方法采集91例AL患儿的骨髓液和124例单纯上呼吸道感染儿童的外周血，提取总RNA，逆转录为cDNA，利用Premier Primer5.0和Oligo6.0软件设计扩增FPGS全编码区的PCR引物，结合PremierPrimer5.0、Oligo6.0和Winmelt2.0软件设计巢式PCR引物，采用PCR-变性梯度凝胶电泳（DGGE）结合DNA直接测序的方法筛查215例样本的FPGS编码区单核苷酸多态性（cSNPs）情况，实验数据应用SPSS13.0统计学软件进行分析，χ2检验比较cSNPs在AL组和正常对照组之间以及在FPGS两亚型之间的差异性，以p<0.05为差异有统计学意义。结果本研究采用PCR-DGGE结合DNA直接测序法对深圳地区215例汉族儿童FPGS全编码区进行筛查，发现了5个突变位点，分别为一个新的错义突变和4个已知的cSNPs。首次在中国汉族儿童中发现了一个国内外尚未见报道的FPGS编码区错义突变502/490T>C（L151/101P），此突变在FPGS两种亚型的基因中均有发现，总等位基因频率为线粒体型（L151P）0.47%、胞浆型（L101P）0.70%，在正常对照组中的等位基因频率为1.21%（L101P）、0.81%（L151/P），AL患儿组未检出此突变即等位基因频率为0（L101P和L151/P）。本研究还检测到了4个国外已报道但国内尚未见报道的cSNPs，即908/896C>T（L286/236L）、1446/1434C>T （R466/416C）、1513/1501G>A（S488/438N）和1516/1504C>T（A489/439V）。它们的等位基因总频率分别为（线粒体型）0.47%、0.70%、0.47%、0.23%和（胞浆型）0.47%、0、0、0.47%。经χ2检验分析此5个突变位点的等位基因频率在FPGS两个亚型之间与两组之间的差异，P>0.05，均无统计学意义，表明这5个位点突变并无亚型之间的差异，与儿童AL亦无易感性关系。此外，本研究人群中并未检测到其它27个NCBI SNP数据库及文献报道中录入的已知cSNPs，包括253/241A>C、293281G>A、303/291C>T、335/323G>T、350/338C>T、380/368C>T、417/405C>T、426/414G>A、441/429C>T、471/459C>T、473/461C>G、756/744G>C、930/918A>G、962/950C>T、965/953C>T、1268/1256C>G、1360/1348T>A、1451/1439C>T、1466/1454G>A、1485/1473G>A、1535/1523T>A、1541/1529C>T、1544/1532C>T、1633/1621G>C、1643/1631A>G、1766/1754C>T和1799/1787C>T。结论首次应用PCR-DGGE结合DNA直接测序法对FPGS cSNPs进行筛查，共检测出5个突变位点，证实DGGE技术是一项可以应用于FPGS基因突变检测的实用技术。首次在中国汉族儿童中发现了一个国内外尚未见报道的编码区错义突变502/490T>C（L151/101P），其等位基因频率为线粒体型（L151P）0.47%、胞浆型（L101P）0.70%，推测其可能对FPGS酶活性及MTX类叶酸拮抗剂敏感性有潜在的影响。首次检测到了4个国外已报道但国内尚未见报道的cSNPs，即908/896C>T（L286/236L）、1446/1434C>T（R466/416C）、1513/1501G>A（S488/438N）和1516/1504C>T（A489/439V），它们的等位基因总频率分别为（线粒体型）0.47%、0.70%、0.47%、0.23%和（胞浆型）0.47%、0、0、0.47%。502/490T>C、908/896C>T、1446/1434C>T、1513/1501G>A和1516/1504C>T在FPGS两种亚型中的分布并无差异，与儿童AL易感性未发现相关性。本研究人群中并未检测到其它27个NCBI cSNPs数据库中录入的已知cSNPs，包括253/241A>C、293281G>A、303/291C>T、335/323G>T、350/338C>T、380/368C>T、417/405C>T、426/414G>A、441/429C>T、471/459C>T、473/461C>G、756/744G>C、930/918A>G、962/950C>T、965/953C>T、1268/1256C>G、1360/1348T>A，1451/1439C>T，1466/1454G>A，1485/1473G>A，1535/1523T>A、1541/1529C>T、1544/1532C>T、1633/1621G>C、1643/1631A>G、1766/1754C>T和1799/1787C>T。