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人类为了追求经济的增长，过度的开发利用导致生态系统遭到破坏，生态服务的系统功能也随之退化。自然保护区是以保护生态环境和自然资源为目的，但是自然保护区的建立会给当地居民的生产生活方式带不利影响。因此，如何协调生态系统保护和地区经济的发展之间的矛盾，是目前自然保护区管理所面临的基本问题。 生态补偿作为协调生态环境保护与经济发展的有效方式，也被广泛用于自然保护区。但是我国在自然保护区生态补偿实践中却凸显了补偿资金来源单一、补偿标准低等一系列问题，这些问题如果不能解决可能会导致生态补偿失败甚至是环境进一步恶化。 本研究的目的在于通过对现有的具有代表意义的自然保护区生态补偿案例在理论和实践上进行研究，找出自然保护区生态补偿机制，以期能够为中国的生态补偿机制提供有益的理论支持。 本研究先通过对相关文献的阅读，对生态补偿的相关研究进行了梳理。然后选取了8个国内外具有代表性自然保护区实施生态补偿的案例，其中5个案例来自国外，3个案例来自国内。利用案例研究的方法，对自然保护区生态补偿的机制进行了界定，提出了自然保护区实施生态补偿的动因，整合了自然保护区生态补偿体系，为我国自然保护区生态补偿的实施提供了理论依据。并以生态补偿主体为标准对案例进行了归类，总结出了目前世界上自然保护区生态补偿的三种模式，并比较了每种补偿模式的优劣势，为我国自然保护区生态补偿机制的研究提供了现实参考。最后研究通过国内外对比研究剖析了我国自然保护区生态补偿的不足同时也提出了改进方案。