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草鱼，四大家鱼之一，是中国重要的经济鱼类。草鱼由于性成熟周期长，传统育种收效甚微，同时和其他经济鱼类面临相似的问题，即人工繁殖带来的种质资源退化。用分子遗传辅助育种和传统育种相结合的方式，寻找草鱼生长相关的分子模块及耦合方式，可大大地缩短良种选育周期，选育出生长速度快、高产、高质的草鱼品种，促进中国草鱼养殖业的健康发展。由于鱼类有着数量大且全同胞群体易得的优势，因此遗传连锁图谱的构建及QTL的定位成为经济鱼类研究中广泛使用的手段。QTL定位的准确度依赖于群体的选择以及连锁图谱的密度两方面。 为了获得生长性状更为优良的亲本组合，本文对24个父本、23个母本和其5331尾混交的子代进行性状测量及亲子鉴定，筛选出一对具有优良生长性状的亲本，并获得其全同胞群体。通过对两个亲本及其F1家系的100个子代进行2b-RAD简化基因组测序，构建了草鱼的高密度遗传连锁图谱。最后结合生长相关表型性状（体重、体长、体全长、体宽）进行QTL定位和GWAS的关联分析。 目前的草鱼遗传连锁图谱密度较低，构建高密度的遗传连锁图谱，一方面可以为草鱼染色体的组装和全基因组的升级提供有力证据，另一方面，也可以将相关性状定位于更精细的区域，便于后期关联基因的查找与分析。本文构建的性别平均遗传连锁图谱包含24个连锁群，4582个SNP位点，总长度为1832.28cM，标记平均间隔为0.4cM，标记最多的连锁群为lg7有289个标记，最少的为lg20有124个标记。在雄性图谱中，2，518个SNP分布在1403.57cM的图谱中，标记间的平均间隔为0.56cM，标记最多的连锁群为lg1有171个，最少的为lg13有60个。雌性图谱中2，309个SNP分布在1496.17cM的图谱中，标记间的平均间隔为0.65cM，标记最多的连锁群为lg7有179个标记，最小的为lg23有48个标记。相较于一代的遗传连锁图谱，本图谱在标记数和标记密度上都得到了飞跃，更有利于QTL的精细定位。 将与生长相关的四个表型数据进行QTL分析，共鉴定出14个QTL位点，由于检测的四个表型间关联性较高，故鉴定出的QTL位点分布在和lg2，lg5，lg15，lg20四个连锁群中的6个标记附近，这6个标记分别是m583，h283，f304，f1574，m2309，f646。其中m583，h283在四个性状特征中均有，且m583的LOD值最高，f1574，m2309单独分布在与体重相关的性状中，f646单独与体高相关，单个QTL可解释的表型变化在14.4％-22.7％。通过GWAS关联分析，可以看出QTL定位区域与关联分析的-log(p)值在趋势上有较高的一致性，说明该结果可靠性强，能为草鱼的分子标记育种提供有力的证据。 此外，在整理实验室历年资料的过程中，鉴定了锚首虫（单殖吸虫）一新种并撰写论文。该虫几丁质结构与河鲈锚首虫在整体上很相似，尺寸略大，背联结棒上有两个突起，背中央大钩基部较后者更粗壮，且在近钩顶处有一明显的小凹。