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目的：以新疆某高校药学硕士专业学位为例，初步建立药学硕士专业学位研究生课程设置方案，实现研究生知识结构和能力素质与现代药学产业发展的有机链接，培养更多胜任岗位需求的高素质药学人才，提高研究生培养质量。 方法：运用文献分析、问卷调查、德尔菲法（Delphi法）等研究方法，对药学硕士专业学位课程设置等问题进行研究。 结果：药学硕士专业学位研究生的课程设置应包括公共必修课程、专业基础课程、专业选修课程、公共选修课程。其中公共必修课为英语、中国特色社会主义理论与实践研究、医学统计学。专业基础课为现代仪器分析、药品注册法规、中药民族药应用开发。专业选修课为现代生药鉴定技术、现代分离技术、药物动力学、物理药剂学、药用辅料基础与应用、现代药剂学、分子生物学、免疫学新进展、高级生理学、心血管药理、现代药物分析、高等有机化学、天然药物合成、药物经济学、病理生理学、流行病应用。公共选修课：由学校统一设置，包括人文类、讲座类、信息类、交叉学科课程。 结论：药学硕士专业学位研究生的课程设置体现了专业性、前沿性、应用性、实践性的特点，为药学硕士专业学位培养方案的建立提供依据。