用定量磷酸化蛋白组揭示RIP3激酶新功能

来源 :厦门大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:chen1052333209
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近期研究表明,RIP3激酶是在程序性坏死中发挥重要作用的激酶。尽管RIP3依赖的细胞坏死在多个生理过程中起重要作用,但是对于RIP3调节的底物却知之甚少。在这个研究中,我们利用分别来源于RIP3+/+小鼠和RIP3-/-小鼠的MEF和Macrophage细胞,在TNF和LPS的刺激下,比较这两者的磷酸化蛋白组的差异,去寻找RIP3激酶的底物。我们分别使用稳定同位素氨基酸标记技术(SILAC)和中介稳定同位素氨基酸标记技术(spike-in SILAC)去标记MEF细胞样品和Macrophage样品,结合强离子交换柱层析(SCX)和金属亲和层析技术,我们一共在Macrophage中鉴定到了3734个蛋白上的11,847个磷酸化肽段以及1,785个蛋白上的4,765个磷酸化肽段。在这些磷酸化肽段中,分别有60和121个磷酸化肽段发现只存在于RIP3+/+Macrophage和RIP3+/+ MEF中,说明这些磷酸化的位点可能是受RIP3激酶所调控的。进一步的生物信息学分析发现,对应于这些位点的蛋白都是参与细胞周期的蛋白。综上所述,RIP3可能拥有新功能,调节细胞周期相关蛋白。
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