【摘 要】
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C2H2型锌指蛋白家族是最大的转录因子家族之一,有文献报道人的基因组中C2H2型锌指蛋白基因的数量多达706个。锌指基序一般山21-23个氨基酸构成,其基本序列为:CX2-4CX3FX5LX2HX3-5H(X代表任意氨基酸),相邻的锌指基序间的序列往往都是高度保守的H/C连接肽(H/C linker):TGEKPYK。而在非锌指区域,C2H2型锌指蛋白中往往还有其他一些保守的效应功能域。根据所含效
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C2H2型锌指蛋白家族是最大的转录因子家族之一,有文献报道人的基因组中C2H2型锌指蛋白基因的数量多达706个。锌指基序一般山21-23个氨基酸构成,其基本序列为:CX2-4CX3FX5LX2HX3-5H(X代表任意氨基酸),相邻的锌指基序间的序列往往都是高度保守的H/C连接肽(H/C linker):TGEKPYK。而在非锌指区域,C2H2型锌指蛋白中往往还有其他一些保守的效应功能域。根据所含效应功能域的不同,可以将C2H2型锌指蛋白分为几个亚类,如KRAB,BTB-POZ,SCAN结构域等等。许多锌指蛋白会通过锌指结构域以一种序列特异性的方式与DNA相结合,从而激活或者抑制基因的转录,在细胞生长与分化、肿瘤发生和胚胎发育形成等生命过程中发挥重要作用。 我们建立了一套新方法用于快速分离人胚胎发育相关的C2H2型锌指蛋白基因:利用其高度保守的H/C linker特征序列“TGEKPYK”设计合成带有生物素标记的负链简并性DNA探针,该探针与4-6周人胚胎总RNA杂交后,用链亲和素包被的磁珠俘获生物素标记的复合物,从而达到富集C2H2型锌指基因的mRNA的目的,用于构建SMART cDNA质粒文库。随机挑选文库克隆测序表明,多数克隆的插入片断为C2H2型锌指基因相关产物。我们从中获得了一个新基因的长为2070bp的cDNA片段,分析发现为小鼠Kid3基因的直系同源基因,我们将其命名为hKid3。通过5’RACE获得了一条约400bp长的cDNA5’端片段,拼接出cDNA序列登录Genbank,登录号AF525463。 拼接出的hKid3的cDNA序列个长2397bp,包含一个1662bp的
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