DHA-1型质粒Ampc酶调控子AmpR转录活性和ampIR序列分析

来源 :哈尔滨医科大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:dongdongthere
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目的:研究DHA-1型质粒AmpC酶调控机制中调控因子AmpR的转录活性、空间结构及ampIR序列特点。方法:以临床分离的产DHA-1型质粒AmpC酶的肺炎克雷伯菌(Klebsierlla pneumoniae1 Kp1)和已纯化的AmpR重组蛋白为研究对象,提取Kp1质粒,设计ampIR引物,采用生物素标记探针和化学发光检测技术,利用凝胶迁移阻滞试验探究ampIR与AmpR蛋白之间的相互作用。采用PCR方法扩增ampR-C(包含ampR、ampIR、ampC)片段,连接pGEM-T Easy载体,测序,并与多株耐药菌的ampR序列比对,分析其序列位点。使用Swiss-Model服务器和SPdviewer4.0.1软件,以铜绿假单胞菌转录调控子PA0477为模板,依据氨基酸一级序列构建AmpR蛋白的三维空间结构。结果:EMSA表明AmpR重组蛋白可与159bp的生物素标记ampIR探针特异地结合,产生“滞后现象”。Kp1质粒ampIR与摩根摩根菌染色体基因同源性达97%,涉及三个碱基(915T→A、933T→C、961C→T)的突变。与其他耐药菌株ampIR比对发现存在约38bp的AmpR蛋白结合位点,且含有T-N11-A序列及特殊的“回文结构”。三维结构显示AmpR与LysR原核转录因子家族相似,氨基端存在螺旋-转角-螺旋结构域,羧基端存在辅诱导物结合结构域。结论:AmpR蛋白可与ampIR结合,具有一定的转录活性,并存在特殊的N-端和C-端结构域。ampIR存在AmpR蛋白的DNA结合位点,含有特殊的序列参与蛋白质氨基端结构域的识别。
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