论文部分内容阅读
新基因p23定位于人染色体1p34.3,编码由203个氨基酸残基构成的假定蛋白,已通过RACE(RapidAmplificationofcDNAEnds)技术、全长cDNA文库检索等技术确定了转录起始位点。在新基因的结构和功能研究中,分析基因的表达调控规律是其重要研究内容之一。为此,我们采用GeneRunner、Proscan和TFsearch等生物信息学软件预测了p23基因及其变异体的5′调控区,对其假定的近端启动子(距转录起始位点约2kb)的核酸序列分析发现其序列中存在1个不典型TATAbox(TATAATAAT)、3个不典型的CAATbox(GGCCCAAT)、7个GCbox(GGGCGG)、1个E2F位点(ATCTCGCGCA)、2个AP1位点(TGASTCAG)和3个AP4位点(TGCAGCTCGTG)。同时,通过分析p23变异体自其转录起始位点起上游800bp的假定调控序列,也发现了1个不典型的TATAbox、3个不典型的CAATbox、6个GCbox、1个AP1位点、1个E2F位点和1个AP4位点。 根据以上生物信息学分析,本文将根据p23假定启动子区域构建的截短体和突变体构建入pGL3–Basic报告基因载体。通过荧光素酶分析比较了一系列重组体的转录相对活性,我们发现p23基因假定近端启动子区具有转录起始调控功能,尤其是以第二个CAATbox(–166bp~–169bp)和第三个CAATbox(–256bp~–259bp)作用显著,是关键的调控元件。此外,针对CAATbox而构建的突变体P2m1、P2m2、P2m3的双荧光素酶相对活性分析结果也证实以上结论。在针对p23变异体的系列重组体进行的双报告基因分析研究中,本研究还发现p23变异体转录起始位点上游第二个CAATbox(–228bp~–233bp)可明显提高转录活性,因此它可能和其它CAATbox协同作用。进而应用电泳迁移率变动分析(EMSA)确定p23基因的近端和远端启动子与转录因子Sp1之间存在相互作用,其确切位置极有可能是近端启动子区上游1724bp处的GCbox7,属CpG岛区域。此外,本文运用染色质免疫沉淀(ChIP)方法来进一步证明p23基因的近端和远端启动子及其变异体的GCbox区域与含Sp1结合因子在内的参与了的转录起始复合物的转录起始过程。 通过此项研究,为进一步研究p23基因及其变异体的表达调控机制和研究p23基因与肺癌等癌症的发生和发展中的作用奠定了基础。