p23基因假定启动子区调控元件的确认和研究

来源 :哈尔滨工业大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:kongshuai19900505
下载到本地 , 更方便阅读
声明 : 本文档内容版权归属内容提供方 , 如果您对本文有版权争议 , 可与客服联系进行内容授权或下架
论文部分内容阅读
新基因p23定位于人染色体1p34.3,编码由203个氨基酸残基构成的假定蛋白,已通过RACE(RapidAmplificationofcDNAEnds)技术、全长cDNA文库检索等技术确定了转录起始位点。在新基因的结构和功能研究中,分析基因的表达调控规律是其重要研究内容之一。为此,我们采用GeneRunner、Proscan和TFsearch等生物信息学软件预测了p23基因及其变异体的5′调控区,对其假定的近端启动子(距转录起始位点约2kb)的核酸序列分析发现其序列中存在1个不典型TATAbox(TATAATAAT)、3个不典型的CAATbox(GGCCCAAT)、7个GCbox(GGGCGG)、1个E2F位点(ATCTCGCGCA)、2个AP1位点(TGASTCAG)和3个AP4位点(TGCAGCTCGTG)。同时,通过分析p23变异体自其转录起始位点起上游800bp的假定调控序列,也发现了1个不典型的TATAbox、3个不典型的CAATbox、6个GCbox、1个AP1位点、1个E2F位点和1个AP4位点。  根据以上生物信息学分析,本文将根据p23假定启动子区域构建的截短体和突变体构建入pGL3–Basic报告基因载体。通过荧光素酶分析比较了一系列重组体的转录相对活性,我们发现p23基因假定近端启动子区具有转录起始调控功能,尤其是以第二个CAATbox(–166bp~–169bp)和第三个CAATbox(–256bp~–259bp)作用显著,是关键的调控元件。此外,针对CAATbox而构建的突变体P2m1、P2m2、P2m3的双荧光素酶相对活性分析结果也证实以上结论。在针对p23变异体的系列重组体进行的双报告基因分析研究中,本研究还发现p23变异体转录起始位点上游第二个CAATbox(–228bp~–233bp)可明显提高转录活性,因此它可能和其它CAATbox协同作用。进而应用电泳迁移率变动分析(EMSA)确定p23基因的近端和远端启动子与转录因子Sp1之间存在相互作用,其确切位置极有可能是近端启动子区上游1724bp处的GCbox7,属CpG岛区域。此外,本文运用染色质免疫沉淀(ChIP)方法来进一步证明p23基因的近端和远端启动子及其变异体的GCbox区域与含Sp1结合因子在内的参与了的转录起始复合物的转录起始过程。  通过此项研究,为进一步研究p23基因及其变异体的表达调控机制和研究p23基因与肺癌等癌症的发生和发展中的作用奠定了基础。
其他文献
目的:流行病学研究表明,脂代谢紊乱是冠心病(coronary heart disease, CHD)的危险因素,也可能影响个体对2型糖尿病( type 2 diabetes mellitus, T2DM)即非胰岛素依赖型糖尿病
用Wigner旋转矩阵和修改的Levenberg-Marquardt算法来描述优选相位交替组合π脉冲,编写了子程序DBCLSF和QRDCMP代表"IMSL"子程序库,解决非线性最小二乘法的问题.计算是在COMP
第一部分:ADCs在肿瘤的靶向治疗中取得了一定的成绩,但是它也存在一定的问题:载药率比较低;偶联药物分子修饰后会导致抗体失效;偶联多个小分子药物导致成分非常复杂;化学偶联药物会
乙醇酸和乙醛酸是光呼吸途径的重要的中间代谢物,它们的积累会破坏DNA、氧化生物膜脂质、修饰蛋白结构、影响某些基因的转录并抑制酶的活性等,对植物体产生严重的毒害作用,最终
拉风个性show,你够青春,够自信,够健康吗?那就快寄靓照来吧! 我喜欢交朋友。独特个性的girl,等待 不付出何获?   杨欢欢  317113 义乌
期刊
植物感受外界光信号的变化,并改变体内一些重要基因的表达,从而导致生长发育的变化。这种信号传导系统包括光信号输入途径,生物钟振荡器系统和信号输出系统三部分。ZTL蛋白既是
期刊
铜绿假单胞菌是一种医院常见的重要的条件致病菌,它可以感染许多免疫系统有缺陷病人,如肺部囊性纤维化(CF)、艾滋病(AIDS)、烧伤和癌症等病人。铜绿假单胞菌所携带的一系列的毒性基
人们惯于将兰花分为国兰和“洋兰”。洋兰是指从国外引进的品种,大花蕙兰就是其中之一。大花蕙兰具有重要的观赏和经济价值。目前国内的大花蕙兰生产所用种苗主要从国外进口,
摘要:爱可以轰轰烈烈,也可以平平淡淡;爱可以刻骨铭心,也可以悄无声息。现在的孩子享受着各方面的爱,有来自父母的、来自爷爷奶奶的、来自外公外婆的等。他们的生活中到处充满着爱,很多孩子对爱已经麻木了,他们把爱当作理所当然的事,这些爱已经让他们不屑一顾。没有注意身边的爱,哪会懂得珍惜爱,不珍惜爱,怎么会感动,没有感动又如何学会感恩。针对这一现状,笔者从三个方面入手,让孩子发现爱、体会爱,从而学会爱人。