斑马鱼IRF11基因的鉴定及初步功能分析

来源 :中国科学院大学 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hxhbj2009
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干扰素(Interferon,IFN)系统在机体抗病毒免疫反应中发挥重要作用。机体细胞在识别病毒感染后,通过一系列信号转导最后激活两种重要的转录因子干扰素调控因子(Interferon regulatory factor, IRF)家族的IRF3和IRF7;激活后的IRF3/7从细胞质进入到细胞核,结合到IFN基因启动子上的ISRE基序启动IFN基因的表达。在脊椎动物中,IRF家族非常保守。哺乳类IRF家族一共有9个成员(IRF1-9),鱼类IRF家族除了有IRF1-9等9个成员外,还有IRF10和IRF11。  早期的研究表明IRF11是鱼类特有的IRF家族成员。查询最近解析的斑马鱼第九版基因组数据时,发现斑马鱼IRF1和IRF11命名出现了混乱。本论文通过对脊椎动物IRF1和IRF11基因位点进行同线型分析表明,IRF1与IRF11是两个不同的基因,不宜命名为IRF1b和IRF1a。系统进化树分析发现,在脊椎动物中IRF11基因比IRF1起源更早;两栖类以后的脊椎动物基因组只有IRF1,没有IRF11,其中原因可能是因为物种在进化过程中基因丢失导致的。斑马鱼IRF11与脊椎动物IRF1一样,其表达蛋白定位在细胞核中。缺失分析揭示斑马鱼IRF11的DBD有一个能引导蛋白定位进入细胞核的序列。表达分析发现poly(I∶C)能诱导斑马鱼IRF11的表达,但其表达水平低于IRF1。功能研究初步揭示过量表达斑马鱼IRF11能激活斑马鱼IFN(ψ)1和IFN(ψ)3启动子,表明斑马鱼IRF11通过正调控干扰素基因的表达在抗病毒免疫反应中发挥功能。最后,利用CRISPR/Cas9基因靶向修饰技术,获得了一批IRF11基因有5个碱基插入以及1个碱基突变的斑马鱼纯合子。
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