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microRNA是一类长度在19—24nt的非编码RNA，通过序列特异的方式调控靶基因。目前靶基因数据主要是通过算法计算而来；然而这些方法之间的重复性不高。如何根据研究的需要恰当选取microRNA靶基因数据已经成为一个亟待解决的问题。由此，不同的靶基因间功能是否一致也就成为一个新的焦点问题。
本文从全新的角度出发，分析microRNA靶基因功能的一致性。选取了四个常用的microRNA靶基因数据库，miRBase，miRGen，miRNAMap，Rna22中的人类及小鼠数据，结合基因功能注释数据库GO，融合七种集合相似性测度，针对靶基因，靶基因所富集的生物学过程，细胞组份，分子功能中的节点进行相似性比较，并对相同家族microRNA的靶基因功能一致性进行了评价。结果显示，miRGen数据库和miRNAMap，Rna22这两个数据库靶基因的相似性较低，但是功能一致性则相对较高(尤其是在细胞组份中)。miRGen和miRNAMap数据库内部由不同程序预测出的结果功能一致性较高，进一步证实尽管不同计算方法预测的microRNA靶基因不同，但其功能具有一致性。
本文提供了在数据库间以及数据库内部重复性较高的microRNA，靶基因富集次数最多的GO节点列表以及详细的一致性分析列表，为microRNA靶基因数据的研究提供了有力指导及理论支持，具有一定的实际应用价值。