论文部分内容阅读
衰老，是所有生物体中最复杂保守的生物学过程之一。多年的研究证明，衰老是由遗传因子调控的，然而，近些年的研究也证明了表观遗传调控机制在衰老过程中发挥重要作用。我们利用染色质免疫沉淀测序技术，对人脑前额叶皮层样本进行了H3K27me3、H3K4me2和H3K27ac三种重要的组蛋白修饰的全基因组信号测定。通过数据分析，一方面，我们观察到抑制型修饰H3K27me3启动子区在年老组中有累积的现象，并且这些基因富集在年老组表达下降的基因中。启动子区DNA基序的分析找到了一些转录因子，其中包含已知和H3K27me3甲基化酶相互作用的基因，从而为进一步的机制分析提供线索。另一方面，我们分析了一种重要的顺式作用原件，即增强子区的活性修饰H3K27ac在衰老过程中的变化和功能。我们首先利用H3K4me2和H3K27ac修饰定义了一组类增强子，然后运用多项式回归和聚类分析找到随衰老上升和下降两种变化模式，并对类增强子相关基因进行了功能富集分析，发现这些基因显著富集在衰老相关的信号通路和神经元分化等生物学功能中。我们进一步挖掘了类增强子区以及启动子区显著结合的转录因子，相互作用网络和文献共引用分析都表明这些转录因子可能在增强子区H3K27ac信号变化与调控衰老中起着重要作用。