计算系统毒理学研究

来源 :第十二届全国计算(机)化学学术会议 | 被引量 : 0次 | 上传用户:wang0525wz
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在日常生活中,要不断接触各种各样的化合物,比如药物、农药、食品添加剂、化妆品、工业化学品等.这些化合物,有的是天然的,但更多的是人工合成的,它们在显著提高生活质量的同时,也带来了健康安全风险,甚至严重的环境污染.因此,如何快速评估这些化合物对人体的潜在毒性已是当务之急.传统的实验方法测定化合物毒性费时、费力,而采用计算机技术评价化合物毒性已成为一种重要的手段.近年来,随着系统生物学的快速发展,使得采用计算方法从系统生物学角度来阐明化合物在体内的毒副作用机制成为可能,因此出现了计算系统毒理学这一新兴学科方向.近几年在计算系统毒理学方面开展了一系列研究。首先,采用统一的医学主题词(MeSH)整合了国际上三个药物副作用相关数据库SIDER,CTD和OFFSmES,构建了药物副作用数据库MetaADEDB。该数据库目前含有3060个化合物(其中1300多个为FDA批准的上市及临床试验药物)及52万多条副作用记录,可通过网络免费检索和下载;基于该数据库,开发了药物副作用预测方法,可对尚未报道的药物潜在副作用进行预测。其次,采用化学信息学和生物信息学技术,开发了基于计算系统毒理学的化合物安全风险评估方法.并针对双酚A等化合物的毒性机制进行预测,构建了双酚A及其类似物与人体毒性相关靶蛋白/基因和疾病的相互关联网络图,进而推测其新的毒性机制。第三,进一步开发了基于药物副作用推理的靶标预测算法,并从数据库中收集了621个上市药物的信息进行靶标预测研究,结果显示具有很好的准确性。详细分析了7个老药的新靶标,预测结果与文献报道的实验结果非常吻合,靶标命中率大于15.9%,其中几个老药的新靶标成功揭示了其多年临床副作用的未知分子机理。
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