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植物microRNA 通过mRNA 切割或翻译抑制来对靶基因进行转录后调控，并对植物的生长发育具有重要调节作用。大量研究表明这些调控过程主要发生在细胞质内，但是植物microRNA 在细胞中发挥功能的具体亚细胞分区却并不清楚。最近的研究表明内膜系统对植物microRNA 的翻译抑制作用具有重要影响，但是内质网是否普遍影响植物体内各种内源小RNA 的功能、以及影响microRNA 作用模式(mRNA 切割或翻译抑制)的特异性等均有待阐明。