【摘 要】
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药物不良反应(Adverse drug reaction)是阻碍新药研发和临床试验的重大问题之一.由于药物不良反应复杂的分子机制,研究者们开发了大量的实验和计算的方法来挖掘它们.研究
【机 构】
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四川大学化学学院,四川,610064
【出 处】
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第十二届全国计算(机)化学学术会议
论文部分内容阅读
药物不良反应(Adverse drug reaction)是阻碍新药研发和临床试验的重大问题之一.由于药物不良反应复杂的分子机制,研究者们开发了大量的实验和计算的方法来挖掘它们.研究表明,大部分的药物不良反应是由药物或药物代谢物与靶标或药物代谢途径中的重要蛋白质相互做用而产生的.因此,识别这些药物不良反应相关蛋白(ADR-related proteins,ADRRPs)是发现药物不良反应、研究不良反应分子机制的有效途径[1,2].本工作借助人类蛋白质相互作用网络的拓扑特征,构建随机森林预测模型,该模型的灵敏度(se)、特异性(sp)和准确度(acc)分别为0.873、0.861和0.868.将模型用于发掘2105个药物靶标中可能的ADRRPs,588个靶标蛋白质被发现参与调节药物的不良反应.通过文本挖掘的方法,一些预测结果获得了实验验证.最终,我们实现了潜在的药物不良反应相关蛋白的有效挖掘.
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