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抗生素在畜禽养殖业的大量使用造成抗生素抗性基因污染日益严重。动物肠道内的抗性菌株经粪便排出后,通过基因水平转移进入土著微生物体内污染土壤、地下水和地表水。堆肥作为一种将动物粪便处理制造肥料的方法,能否有效地去除畜禽粪便中抗生素抗性基因,防止环境污染值得我们探讨。本文总结了畜禽粪便抗生素抗性基因污染现状,堆肥过程中微生物群落的变化与影响微生物变化的因素以及堆肥对粪便中抗生素抗性基因的影响,提出利用粪便堆肥去除抗生素抗性基因,可以添加有效的化学调理剂和菌剂,或者加入特定的对携带有抗生素抗性基因的肠道微生物有抑制和灭杀效果的化学试剂,实现降低进入土壤环境中抗生素抗性基因丰度的可能。强调开展畜禽养殖业抗生素抗性基因研究的必要性,建议有效的将堆肥和抗生素抗性基因研究结合起来,更好的降低这种新型污染物的污染水平。