大黄鱼CD4-L、CD8α分子的克隆与序列分析

来源 :第五届青年海洋科学研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:jinmeng79
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  本研究应用RACE技术,从经poly I:C诱导的大黄鱼脾脏提取的总RNA中扩增出大黄鱼CD4-L、CD8α基因,序列分析表明CD4-L基因含927bp的开放阅读框,编码309个氨基酸;CD8α基因含687bp的开放阅读框,编码289个氨基酸。利用生物信息学和分子生物学以及分子生物学软件对大黄鱼CD4-L、CD8α基因编码的蛋白进行结构的预测表明,大黄鱼CD4-L成熟蛋白是分子量33.56 kD,等电点为9.67的跨膜蛋白,由信号肽、胞外区、跨膜区(N230-N252)和胞浆区4个部分构成。胞外区含有2个1g样结构域(IG-like)(N18-N109)(N1 13-N184),该多肽链具有4个二硫键(N33-N94N、128-N166、N210-N213和N239 N253),及2个N糖基化位点(N113,N212);大黄鱼CD8α成熟蛋白是分子量为25.08kD,等电点为9.16的跨膜蛋白,由信号肽、胞外区、跨膜区(N174-N196)和胞浆区4个部分构成.胞外区含有1个1g样结构域(V-set)(N15-N127),该多肽链具有4个二硫键(N197_N205、N145_N151、N153_N171和N38_N107)。胞浆段具有区别于哺乳动物特有的高度一致带电基序R-T-K-R-C-P-H-H。这为大黄鱼CD4-L、CD8α蛋白结构与功能的进一步研究奠定了基础。
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