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蛋白质组基因组学是近几年诞生的一门用蛋白质组数据信息，也是结合转录组数据来解析基因组的新兴学科.MS/MS 质谱实验辅助基因组注释已经在多种物种中成功运用.这里我们整合腾冲嗜热菌的多温度条件下的蛋白质组质谱数据及转录组深度测序数据进行分析.结果显示：(1)转录组数据可以覆盖70％以上的2588 核酸库基因；(2)74％以上的质谱鉴定肽段可以寻找到转录组证据.