2016年我国部分地区新亚群类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒的遗传变异分析

• 作 者: 张洪亮[1]张晶[1]李真[1]张文立[1]刘春晓[1]陈家锃[2]相丽润[1]冷超粮[3]彭金美[1]王倩[1]白云[2]安同庆[1]童光志[4]蔡雪辉[1]田志军[1]
• 机 构: 中国农业科学院哈尔滨兽医研究所,黑龙江哈尔滨150069
• 出 处: 中国畜牧兽医学会生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第十二次学术研讨会
• 发表日期: 2016年期

为了解类NADC30猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)在中国新的流行特征,本研究根据GenBank中美国2012年提交的PRRSV NADC30株全基因组序列设计合成8对引物,通过RT-PCR的方法对本实验室2016年从4个省搜集的临床样品中检测到的15株类NADC30PRRSVs株进行了全基因组测序,并且结合参考株进行了序列分析.NSP2推导氨基酸的序列比对表明,15株PRRSs均具有aa323～aa433+aa484+aa505～aa523(111+1+19)131个氨基酸缺失的分子特征;经RDP4和Simplot生物学软件分析表明,15株PRRSVs中14株为重组病毒株,参与重组的亲本病毒林为PRRSV NADC30株,提供重组基因片段的病毒株为HP-PRRSV或以VR2332为代表的经典PRRSV株,这些是NADC30重组病毒株的重组位置、重组的基因片段及重组片段长度均具有多样性,而且重组的位置多位于编码非结构蛋白或次要结构蛋白的基因区域;全基因组遗传演化分析表明,这些病毒株远离国内之前流行的HP-PRRSV,同源性仅为83.4％～87.2％,而与其它的类NADC30病毒株位于一个相对独立的分支,以上结果均表明这类病毒株已形成了一个新的亚群,命名PRRSV5亚群.本研究中不同地区PRRSV的核苷酸同源性差异较大,仅为88.6％～99.6％,并且仅有2个病毒株可以感染PAM和MARC-145细胞.本研究表明,以基因缺失和基因重组多样性为主要特征的5亚群PRRSV已在中国流行,其生物学特性有待进一步研究.