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教学实验室建设及管理是高校实验室管理的一项重要内容，近年来，高等教育对学生实践创新能力培养对实验教学提出了更高的要求，以中央财政支持地方高校基础能力建设和中西部高校基础能力建设工程等专项资金项目的实施，教学实验室的建设得到了较快的发展。然而，在以培养生物大类专业本科生实践创新能力为主的微生物教学型实验室在建设和管理的过程中存在着一些问题，通过分析教学型实验室开放运行中存在的一些共性问题，提出建设绿色环保微生物实验室建设的思路，以吉首大学为研究对象，初步探讨了绿色环保微生物实验室管理模式。通过微生物绿色环保教学实验室建立资源集约化、功能模块化、质量控制标准化、文化建设常态化的实验教学平台，进一步改革实验教学手段和教学方法，有利于生物大类专业学生的创新实践能力培养。