【摘 要】
：
随着计算机技术的方法，基于分子对接的虚拟高通量计算受到了越来越多的关注，已经成为了创新药物研发的核心技术之一。但分子对接方法存在的一些固有缺陷会影响虚拟筛选预测
【机 构】
：
浙江大学药学院,杭州市西湖区余杭塘路866号,310058
论文部分内容阅读
随着计算机技术的方法，基于分子对接的虚拟高通量计算受到了越来越多的关注，已经成为了创新药物研发的核心技术之一。但分子对接方法存在的一些固有缺陷会影响虚拟筛选预测结果的精确度，如简化的打分函数和对靶点蛋白质柔性的忽略等。我们课题组对如何提高虚拟筛选的效率和精度进行了系统的探讨和研究，主要包括：(1)对基于连续介质模型的MM/PBSA和MM/GBSA自由能计算方法进行了系统的评估，指出了这两种方法的优势和缺陷，证明了这两种方法在虚拟筛选后处理中的有效性[1～3]；(2)发展了基于残基-配体能量分解和机器学习技术的MIEC-SVM方法，通过多个体系的研究表明了其在多肽类药物设计和虚拟筛选中具有广阔的应用前景[4～5]；(3)对靶点蛋白柔性对虚拟筛选的影响进行了系统的探讨，指出了基于多构象虚拟筛选的重要性，并提出了多构象虚拟筛选结果整合的有效策略[6～8]。
其他文献
初中是学生巩固知识、发展能力的重要时期,课外阅读作为教材课文学习的有效延伸,如何在其教学过程中开掘学生语言意识、提高其阅读理解能力是教师当今时代下的教学新探索.因
目前，在光谱定量分析的实践中采用的光谱定量分析理论基本上都是建立在兰伯比尔定律或类似的线性模型基础上的，其前提是样本光谱的信号强度与样本中待测化学组分的浓度成线
本论文对Enterobacter cloacae (E. cloacae)的内切葡聚糖酶ce18A和Bacillus licheniformis (B. licheniformis)的外切葡聚糖酶ce148B进行研究。首先,克隆表达E. cloacae的内
基于非线性的基因表达式编程(GEP)进行过氧化物酶体增殖物激活受体(PPAR)三个系列化合物的研究，建立EC50值的定量构效关系模型(QSAR).分子描述符代表的化合物的特性，利用软
巨噬细胞移动抑制因子(Macrophage migration inhibitory factor,MIF)是炎症效应的一种重要调节剂,又是先天性免疫响应的主要上游介导剂.大量的研究表明,MIF直接影响正常
应用傅立叶衰减全反射在线红外技术结合核独立成分分析(kernel independent component Analysis,KICA)研究3,5-二氨基-1,2,4-三唑的合成机理。通过在线红外技术获取整个
冲锋,是一名战士时刻应该保持的姿态。而作为一名军事记者,本质上说就是一名军事新闻战线的战士。从地方大学毕业后,我穿上海军蓝,开始在碧海蓝天间不停地奔跑,一晃已有10多
本论文详细的综述了锂离子电池及正极材料聚阴离子型系列材料的研究现状。以聚乙二醇为碳源，分别合成了LiFePO4/C、Li3V2(PO4)3/C和xLiFePO4·yLi3V2(PO4)3/C正极材料。聚乙二
在现代集约化高密度养殖模式下,养殖过程中大量的残饵,粪便排泄物,动植物尸体等含氮有机物污染严重,因此本实验主要以氨氮和亚硝态氮降解能力为主要筛选指标进行目的菌株的筛
植物非特异性转脂蛋白(nsLTPs)是一类广泛存在于高等植物中的碱性小分子蛋白家族。许多研究表明，生物和非生物胁迫能够诱导nsLTPs过表达，并且nsLTPs能不同程度的诱导植物系统性