【摘 要】
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长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是广泛存在于动物细胞中的一类非编码蛋白序列,在动物机体发育过程中起到了重要的调节作用,并且lncRNA 作用机制在许多的哺乳动物细胞中已经被鉴定。然而,鸡作为一个拥有取材方便、数量庞大等优点的模式动物,其lncRNA 的作用机制尚不明确。这里,我们运用RNA-Seq 技术对鸡胚胎干细胞(Embryonic stem cell,
【机 构】
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扬州大学动物科学与技术学院,江苏省动物繁育与分子设计重点实验室,扬州225009
【出 处】
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中国畜牧兽医学会家禽学分会第十七次全国家禽学术研讨会
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长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是广泛存在于动物细胞中的一类非编码蛋白序列,在动物机体发育过程中起到了重要的调节作用,并且lncRNA 作用机制在许多的哺乳动物细胞中已经被鉴定。然而,鸡作为一个拥有取材方便、数量庞大等优点的模式动物,其lncRNA 的作用机制尚不明确。这里,我们运用RNA-Seq 技术对鸡胚胎干细胞(Embryonic stem cell,ESC)、原始生殖细胞(Primordial germ cells,PGC)和精原干细胞(Spermatogoniastemcell,SSC)三种细胞进行测序与分析,筛选出显著性差异以及特异性表达的lncRNAs,使用qRT-PCR 对测序结果验证,同时对候选lncRNAs 进行靶基因预测以及lncRNA 与靶基因的网络互作分析。结果表明在三组细胞中共存在9657 个lncRNAs,其中3549 个差异显著。通过筛选,三组细胞中差异极显著以及特异性表达的lncRNAs 共有20个,qRT-PCR 结果显示这些lncRNAs 的表达趋势与RNA-Seq 中一致。同时,通过靶基因预测,共预测出25 个cis 靶基因和6 个trans 靶基因,其中的TRIM8、HAT1、CNAQ 和LYSMD3 存在于RNA-Seq 结果中。我们的研究初步揭示了lncRNA 对鸡雄性生殖细胞分化的调控机制,拓宽了lncRNA 动向机制的研究层面,为鸡lncRNA 的研究奠定了理论基础。
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