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经证实，人类基因数目只有3万个左右,这甚至比一些植物的还少，但在进化水平上人类却无疑高级得多,人们推测一个重要原因是人类基因大量(35％以上)涉及mRNA可变剪接，mRNA的可变剪接使得一个基因能表达出多个不同的蛋白质，这使得人在蛋白质组水平上表现出极高的复杂性。
本文对mRNA可变剪接分析软件AltSplice进行了并行优化分析与优化方案的选择，分析解决了原AltSplice软件中Nbest参数选取欠合理的问题,结合实验实现了基于MPI平台的并行AltSplice版本，并在5万亿次的联想深腾6800高性能计算机上获得了较好的运行性能。