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生物钟如同一个相互耦合的齿轮系统，驱动着生物体生命活动的节律。准确灵敏地感知个体生物钟的周期、相位和强度，及其对环境和食物变化的响应，对于发展时间生物医学的基础理论和精准个性化医疗技术具有重要意义。近来的研究工作表明，生物钟可以影响斑马鱼的明暗偏好和群体偏好，从而决定了斑马鱼的环境选择和生物钟调节模式。长时间的环境有害物暴露，如双酚A暴露，大大降低斑马鱼明暗偏好和群体偏好的昼夜节律性，增加了野生鱼类的生态风险。生物钟可以调节植物中营养成分的合成、积累和利用，因而影响中药材功能成分的含量和生物可利用率，基于多光谱成像的新技术可以对叶绿素及其他营养组分进行长时间的无损监测。现有的实验证据表明，食物对生物钟的影响存在多个层面和途径。不仅进食时间可以调控生物钟，食物中的许多成分，如色氨酸、维生素D等，能影响褪黑素合成途径直接影响生物钟；其次，铁等元素可通过影响肝生物钟调节人体生物钟；此外，食物诱导的胰岛素分泌也可以对生物钟重新设定。我们在介绍食品、环境与生物钟调控网络领域研究成果的同时，也将对时间生物医学的相关发展方向进行展望。