【摘 要】
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JAK2/STAT3信号转导通路在免疫调节和脂肪代谢等过程中起着重要调控作用.本实验利用cDNA末端快速扩增(RACE)法获得草鱼STAT3基因全长,采用生物信息学对该基因及其编码蛋白12个特征进行分析预测,并应用RT-PCR构建STAT3在草鱼中的组织表达图谱.结果表明,草鱼STAT3基因的cDNA全长序列长2739bp,包含2223bp的ORF和216bp5UTR、300bp3UTR,编码合成
【机 构】
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上海海洋大学水产与生命学院,上海201306
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JAK2/STAT3信号转导通路在免疫调节和脂肪代谢等过程中起着重要调控作用.本实验利用cDNA末端快速扩增(RACE)法获得草鱼STAT3基因全长,采用生物信息学对该基因及其编码蛋白12个特征进行分析预测,并应用RT-PCR构建STAT3在草鱼中的组织表达图谱.结果表明,草鱼STAT3基因的cDNA全长序列长2739bp,包含2223bp的ORF和216bp5UTR、300bp3UTR,编码合成740个氨基酸.STAT3所编码的氨基酸序列与斑马鱼、青鳉、大菱鲆、红点鲑、鳜鱼、虹鳟和绿河豚等鱼类的同源性达94％～99％.草鱼STAT3蛋白包含蛋白质交互作用结构域、alpha结构域、DNA结合结构域和SH2结构域.该蛋白为亲水性的非分泌蛋白,分子质量为85412.1 Da,等电点为6.39,蛋白质为α-helix/β-sheet/loop混合型.草鱼STAT3基因在肝脏、脾脏、鳃、肌肉、心脏和脑中均有表达,以在肝脏组织中表达量最高,显著高于其他组织(P＜0.05),在心脏组织中表达量最低(P＜0.05).本实验结果为进一步研究草鱼STAT3的结构、功能、信号转导等提供了依据.
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