【摘 要】
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目的:应用转录组测序技术(RNA-sequencing,RNA-seq),研究G6PD低表达对苯致小鼠骨髓细胞毒性信号通路的影响.方法:将G6PD低表达C3H/He小鼠和G6PD正常表正C3H/He小鼠随机分为两组,每组10只,以0、160mg/(kg.d)浓度的苯皮下注射染毒,1周5次,连续4周,染毒结束后,提取小鼠骨髓细胞进行RNA-seq检测,对测序结果的差异基因进行基因功能(GO)、信号通
【机 构】
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东南大学公共卫生学院,环境医学工程教育部重点实验室,江苏南京210009
【出 处】
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第十三届全国环境与职业医学研究生学术研讨会
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目的:应用转录组测序技术(RNA-sequencing,RNA-seq),研究G6PD低表达对苯致小鼠骨髓细胞毒性信号通路的影响.
方法:将G6PD低表达C3H/He小鼠和G6PD正常表正C3H/He小鼠随机分为两组,每组10只,以0、160mg/(kg.d)浓度的苯皮下注射染毒,1周5次,连续4周,染毒结束后,提取小鼠骨髓细胞进行RNA-seq检测,对测序结果的差异基因进行基因功能(GO)、信号通路富集分析和基因共表达生物信息学分析.
结果:RNA-seq结果显示,相同苯染毒浓度下,比较G6PD低表达小鼠和G6PD正常表正C3H/He小鼠,共筛选到223个差异表达基因,其中上调基因为105个,下调基因为118个.基因功能和信号通路富集结果显示,差异表达基因主要富集在代谢、磷酸戊糖、应激反应、氧化还原反应、NADPH再生、凋亡、谷胱甘肽代谢、脂肪酸代谢、炎症、MAPK、ErbB、GnRH、HIF-1、TNF、VEGF、NF-KB、急性髓性白血病等相关功能和通路上.通过差异基因共表达分析发现,调控能力较高的基因主要有G6pdx、Ltb、,Siglece、Orail、Hck,是NF-KB信号通路、细胞黏附、cAMP、免疫等相关的功能和信号通路上的重要基因.
结论:转录组测序结果共筛选到223个差异表达基因,主要富集在代谢、磷酸戊糖、应激反应、氧化还原反应、NADPH再生、凋亡等相关功能和通路上,其中G6pdx、Ltb、Siglece、Orail、Hck发挥着重要作用.
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