Diagnosis value of aberrantly expressed microRNA profiles in lung squamous cell carcinoma:a study ba

来源 :第十三届全国环境与职业医学研究生学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:hu_jie
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  [Objective]Lung cancer is considered as one of the most frequent and deadly cancers with high mortality all around the world.It is critical to find new biomarkers for early diagnosis of lung cancer,especially the lung squamous cell carcinoma(LUSC).The Cancer Genome Atlas(TCGA),is a database which provides both cancer and clinical information.This study is a comprehensive analysis of a novel diagnostic biomarker for LUSC,based on TCGA.[Methods]The present study investigated LUSC-specific key microRNAs(miRNAs)from large-scale samples in TCCA.Expression profiles of miRNAs with related clinical information of 332 LUSC patients were got from TCGA.Most remarkable mutative miRNAs were identified between tumor and normal samples.[Results]Totally 42 LUSC-specific intersection miRNAs(fold change>2,P<0.05)were obtained by comparing in Level 3,among them six miRNAs were found to be aberrantly expressed concerning clinical features(gender,lymphatic metastasis,patient outcome assessment).Then five miRNAs were correlated with overall survival(log-rank P<0.05).Also,the diagnostic value of these above five miRNAs was determined by areas under receiver operating characteristic curves(ROC).Finally,577 interaction mRNAs as the targets of 42 LUSC-specific intersection miRNAs were selected for further bioinformatics analysis.[Conclusion]This study indicates that the novel microRNA expression signature may be a useful biomarker of the diagnosis for LUSC patients,based on bioinformatics analysis.
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