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城市生态系统是典型的人工生态系统，是社会.经济.自然复合生态系统，城市有城市的生态，失去平衡对人类生存和健康发展均不利。城市轨道交通建设对城市生态有一定的影响，在城市轨道交通规划环境影响评价中重视对城市生态的影响评价是十分必要的。本文概述了城市生态系统的组成及特点，分析了城市轨道交通建设的特点及主要环境影响因素、影响特征，从城市绿地、城市湿地、城市动物、城郊土壤、城市景观、文物古迹等方面总结评价城市生态影响的指标体系，并指出评价可能涉及的主要技术方法，分析了城市轨道交通规划实施对城市生态可能产生的主要生态影响。最后，提出了轨道交通规划环境影响评价中减缓对城市生态系统不利影响的对策和建议。