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植物叶片病原菌同植物宿主之间存在着非常复杂的相互作用，包括在植物叶表生长时期和叶内致病时期。以丁香假单胞菌为模式菌，我们利用比较转录组学工具研究，研究它是如何适应这些叶表和叶内环境的以及遭受了何种环境压力。我们提出了一个有关丁香假单孢杆菌在植物宿主上生长致病的动态模型，从而揭示了病原菌与植物宿主之间相互作用的分子机制。进一步研究发现，水分胁迫是限制该菌在植物宿主上生长致病的最主要的压力。我们系统的鉴定了影响丁香假单胞杆菌在植物宿主上生长致病的基因调控网络，是首个关于植物叶片病原菌与宿主分子互作的转录组学研究。