【摘 要】
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该研究探讨了鹿科6属动物主要组织相容性复合体dra(mhc-dra)第二外显子的变异特点,揭示其分子水平上的进化选择模式,并与cyt b进行了比较.文章采用测序法,获得鹿科6属动物dra
【机 构】
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圈养野生动物技术北京市重点实验室,北京动物园,北京,100044兽医院,北京动物园,北京,100044
【出 处】
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2016年度北京动物园科技大会暨圈养野生动物技术北京市重点实验室工作研讨会
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该研究探讨了鹿科6属动物主要组织相容性复合体dra(mhc-dra)第二外显子的变异特点,揭示其分子水平上的进化选择模式,并与cyt b进行了比较.文章采用测序法,获得鹿科6属动物dra第二外显子序列246bp的序列.研究结果表明,多态性位点数18个,独立变异位点13个.mhc-dra第二外显子显示出较低的核苷酸变异,且6属有各自独特的变异位点.氨基酸序列中抗原结合位点共计20个.其中,鹿科6属动物的氨基酸位点63,驼鹿属氨基酸位点18,是不同于马属和人属的抗原结合位点,推测鹿科动物可能有着不同的抗原结合模式.根据非同义替代率(Ka)和同义替代率(Ks)比值的计算结果,表明鹿属mhc-dra第二外显子为正向选择,其余5属均为纯化选择.对mhc-dra第二外显子及cyt分别运用邻接法(NJ),最大似然法(ML)和贝叶斯推论(BI)进行系统发育重建得到相似结果,形成了旧世界鹿类与新世界鹿类的姐妹类群.麂亚科cyt b和mhc-dra第二外显子的基因型可能是鹿亚科与其它亚科之间的过渡型,而气候变化和环境变迁可能是推动mhc-dra第二外显子分化的潜在原因.
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