金花茶花瓣异戊烯焦磷酸异构酶(IPI)基因同源片段扩增与生物信息学分析

来源 :2016中国东兴金花茶首届国际论坛 | 被引量 : 0次 | 上传用户:yangxfg
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利用RT-PCR技术,从金花茶花瓣中提取得到花瓣总RNA,经反转录后生成cDNA.根据Genbank中已经公布的有关物种的异戊烯焦磷酸异构酶(isopentenyl diphosphate isomerase,IPI)蛋白序列设计同源引物,以总cDNA为模板,经PCR扩增后得到金花茶基因IPI的cDNA序列.测序结果表明,该同源序列长度为646bp.碱基序列多重比对分析表明金花茶IPI与茶(Camellia sinensis)(KT943506.1)的同源性高达99%,与豆科植物如黄芪(Astragalus)、大豆(Glycine max)等植物的同源性高达81%,表明IPI具有物种保守性.本研究为进一步研究金花茶IPI基因及其在类胡萝卜素合成途径中的作用奠定了基础.
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