【摘 要】
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氢键广泛存在于生物体系中,对蛋白质和核酸的结构和功能有重要影响。高精度从头算方法能较好地描述氢键作用,但无法应用到蛋白质核酸等复杂体系中。基于人们对氢键本质的
【机 构】
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辽宁师范大学化学化工学院,大连,116029
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氢键广泛存在于生物体系中,对蛋白质和核酸的结构和功能有重要影响。高精度从头算方法能较好地描述氢键作用,但无法应用到蛋白质核酸等复杂体系中。基于人们对氢键本质的理解,我们建立了一种可快速预测氢键复合物结构和作用能的模型------可极化偶极-偶极作用模型。我们将化学键 C=O、N-H、C-H、C-O 看作偶极,将碱基 A、G、C 中 sp2 杂化氮原子上的孤对电子看作偶极,通过模型分子确定了相关参数。我们使用该模型对包含酰胺、多肽、碱基 A、T、G、C、U、核糖、葡萄糖、蔗糖等分子的氢键复合物的氢键结构和氢键作用能进行了计算,并将计算结果与 MP2 方法的结果进行了比较。结果表明：我们模型得到的氢键结构与 MP2/6-31+G(d,p)方法得到的氢键结构符合的较好；我们模型得到的氢键作用能与包含基组重叠误差校正的 MP2/aug-cc-pVTZ 方法的结果符合的较好。希望此模型能够为人们研究和理解生物体系中氢键作用提供新的思路。
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