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内部治理结构作为现代大学制度建设的核心内容，其设计理念集中体现了大学的制度文化特性。高职院校内部治理存在主体相对单一、学术权力薄弱、师生参与管理渠道不畅等诸多问题，迫切需要结合高职院校特色，完善内部治理结构，正确处理政治权、行政权、学术权和民主权之间的关系，建立科学的领导—决策—执行—监督机制。南京铁道职业技术学院以参加江苏省教育体制改革为契机，通过做好改革顸层设计，以章程建设为引领，对党委领导下的院长负责制、教授治学体系、民主管理、理事会制度等进行了重点探索，在制度文化建设方面取得了一定成效。