水稻纹枯病菌蛋白质互作网络模型的预测及验证

来源 :中国植物病理学会第十一届青年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:xingzhe1689
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  水稻纹枯病是一种世界性病害,为水稻三大病害之一.水稻纹枯病的病原菌为立枯丝核菌(Rhizoctonia solani Kühn),属半知菌亚门真菌,是一种土壤习居菌,分布范围和寄主范围广,立枯丝核菌种内成员复杂,致病的主要菌丝融合群绝大部分为AG-1.到目前为止,我们对立枯丝核菌的致病机理仅对少量的单个基因进行研究,对该类病害的致病机理并不了解.构建水稻纹枯病蛋白质相互作用网络能使我们从宏观上对整个生物功能进行一个全面系统了解,有助我们从一个系统生物学的角度审视和理解细胞和细胞间的生物学过程.在我们的研究中,采用同源映射的方法,利用5个模式物种的蛋白质相互作用数据预测纹枯病菌的蛋白质相互作用网络.通过GO注释,结构域相互作用,基因共表达和酵母双杂交实验等证据评估网络质量,并对整个网络的拓扑属性进行分析,结果表明纹枯病菌的蛋白质相互作用网络符合scale-free属性.同时,我们还对网络中的功能模块进行分析,特别是对致病蛋白和分泌蛋白互作网络的分析,以预测互作蛋白的致病相关功能.蛋白质相互作用网络有助于我们预测关键水稻纹枯病致病因子及后续致病机理研究具有指导意义.
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