立枯丝核菌Rhizoctonia solaniAG-1亚群的比较转录组研究

来源 :中国植物病理学会第十一届青年学术研讨会 | 被引量 : 0次 | 上传用户:liteary
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  立枯丝核菌Rhizoctonia solani AG-1是一类重要的植物病原菌,寄主达到近50种,包括水稻、玉米、大麦、大豆、莴苣、番茄等多种重要粮油作物及蔬菜水果,其中由Rhizoctonia solani AG-1 IA引起的水稻纹枯病是水稻的三大病害之一。本研究的目的在于从病原菌转录组水平寻找病害侵染和发生机制的可能性依据,为病原菌的有效防治提供可靠的理论依据。为此,我们通过Illumina GA Ⅱ技术完成3个亚群IA、IB和IC的转录组测序、组装和注释,并对3个亚群转录组进行比较和分析,完成基因的KOG分类,同时侧重对这3个亚群转录本的SNP位点、可变剪切、新转录本以及致病因子分泌小蛋白进行预测和比较分析,试图寻找亚群间致病性的特异性和相似性,以及可能的进化特点。研究对转录组数据进行验证,随机选取了组装序列进行PCR验证,与测序结果一致性达到98%,验证组装结果可靠性;同时对致病因子的可变剪切类型进行实验验证,说明了在转录水平水稻纹枯病致病因子的调控特点。另一方面,对3类亚群转录表达预测与致病性存在高度关联的富半胱氨酸的分泌小蛋白基因进行克隆和诱导表达,对寄主的HR生物活性检测显示,部分蛋白对不同寄主玉米、大豆和水稻具有诱导PCD活性,揭示了不同亚群致病菌的致病特点。
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