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采用3种不同的限制性内切酶AluI、RsaI、HaeIII,通过富集文库-菌落原位杂交法,构建了3个仿刺参微卫星DNA富集文库,共获得微卫星DNA序列583个,根据微卫星DNA的两翼序列设计了188对引物,筛选得到123个有多态性的位点。另外,对微卫星标记在仿刺参F1代家系中的分离方式进行了研究。采用45个已发表的微卫星标记,以3个F1代全同胞家系、每个家系各50个子代个体为实验材料,进行扩增分析,结果显示3个家系中偏离孟德尔分离的位点比例分别为17.39%、16.67%、19.23%。筛选仿刺参微卫星DNA标记、分析其在F1代家系中的遗传分离情况,为仿刺参微卫星遗传连锁图谱的构建、数量性状位点(QTL)的定位和选育品系的遗传分析提供了一定的理论依据。